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期刊信息/Journal information
西南农业学报
西南农业学报

李跃建

双月刊

1001-4829

Jxuebao@sina.com

028-84504004

610066

成都市外东沙河大桥侧

西南农业学报/Journal Southwest China Journal of Agricultural SciencesCSCD北大核心CSTPCD
查看更多>>本刊是由四川、云南、贵州、广西、西藏和重庆六省市农科院、所，共同举办的国内外公开发行的综合性农业学术期刊。主要刊登农牧业各个学科应用基础研究、应用技术、区域综合开发和软科学方面的研究报告、专题论文、研究简报、学科进展述评等文章。本刊立足于大西南、面向全国、分学科地、及时地、有见地反映西南地区农业科学研究新成果、前沿动态，以推动农业科研、教育和生产的发展。本刊热忱欢迎全国农业工作者投搞，订阅。
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    香樟NAC基因家族的全基因组鉴定及盐胁迫下的表达分析

    曾伟伟李一凡朱渊铭林宇清...
    1393-1408页
    查看更多>>摘要：[目的]探究NAC基因在香樟(Cinnamomum camphora)生长发育及其在盐胁迫下发挥的重要作用,为进一步阐明香樟在盐胁迫下的响应机理奠定基础.[方法]对香樟全基因组NAC基因进行鉴定和生物信息学分析,探究香樟非生物胁迫的响应模式.通过对香樟NAC家族成员进行鉴定,并从理化性质、系统进化分析、保守基序、基因结构、染色体定位、物种间共线性、顺式作用元件预测和表达模式等方面进行系统分析.[结果]共鉴定出103个香樟NAC基因,氨基酸数量介于137～1136个,等电点在4.54～10.00,相对分子质量在15 644.40～129 859.29 u,平均疏水性全部为负值,均为亲水蛋白,亚细胞定位预测定位在细胞核和细胞质中;通过与拟南芥(Arabidopsis thaliana)NAC基因序列构建系统发育进化树发现,香樟NAC基因被划分为16个亚家族,其中NAM亚家族成员最多,有17个香樟NAC基因,还有25个香樟NAC基因未参与分组;保守基序和基因结构分析发现,香樟NAC基因包含有2～8个内含子和10个motif,其中motif3在香樟基因遗传进化中趋于稳定,motif9和motif10多数分布在NAM亚家族中;染色体定位和复制事件分析发现,103个NAC基因分布在12条染色体中,基因分布最多的是Chr02号染色体(13个CcNAC基因),最少的是Chr10和Chr11(各2个基因),片段复制为香樟NAC家族的主要扩增方式;多物种共线分析发现,香樟与牛樟(Cinnamomum kanehirae)NAC基因形成162对共线基因,多于其它物种,说明香樟NAC基因与牛樟之间的同源进化关系比其他物种更密切;香樟NAC基因启动子中含有多个非生物胁迫、生长发育和激素类响应元件;qRT-PCR结果表明,在叶中,CcNAC058和CcNAC092基因的表达水平在低盐胁迫下达到最大.在根中,CcNAC007、CcNAC033、CcNAC058和CcNAC092基因的表达随着盐浓度的增加而增加.[结论]NAC基因家族在香樟的生长发育进程中可能参与盐胁迫响应过程,在盐胁迫下CcNAC092、CcNAC058基因在叶片、根部均具有明显的响应,推测CcNAC058、CcNAC092是促使香樟在盐胁迫下能产生自我防御行为的关键基因.

    香樟NAC基因家族盐胁迫全基因组分析

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    不同海拔下花椒叶片差异表达基因的结构变异

    杨明丽黄仙婍喻阳华王继玥...
    1409-1419页
    查看更多>>摘要：[目的]探明不同海拔梯度对花椒基因表达的影响,为研究花椒遗传多样性、代谢调控及适应不同海拔生境胁迫的分子机制提供依据.[方法]以贵州省贞丰县板贵乡不同海拔(1054、821和645 m)下的花椒叶为试验材料,采用转录组测序的生物信息学方法对其差异表达基因的可变剪接(AS)和SNP/InDel变异位点进行解析,挖掘花椒适应环境的新转录本.[结果]在3个不同海拔的花椒叶片中,有2619个基因发生了可变剪切事件,主要为外显子跳跃(Skipped exon,SE)和互斥外显子(Mutually exclusive exons,MXE)2种类型,其中SE最多,且在高海拔的对比组中发生可变剪接的数量显著增多;鉴定出748 331个SNP和87 402个In-Del 位点,SNP 类型中转换种类高于颠换种类,在外显子区分布最多,达 40.0％.InDel位点在内含子区分布最多,达28.6％;发掘出9363个新转录本,其中有5648个在7大数据库中被注释.KEGG代谢途径分析发现,花椒叶片发生可变剪接的功能基因主要参与代谢途径、次生代谢物的生物合成和辅助因子的生物合成途径;而新转录本的KEGG代谢途径主要富集于光合作用、苯丙素生物合成、异黄酮生物合成、类黄酮生物合成和萜类生物合成等通路.[结论]本研究丰富了对不同海拔条件下花椒基因结构变异的认识,为后续研究花椒遗传多样性、代谢调控及响应环境胁迫的分子机制奠定基础.

    花椒差异表达基因可变剪接新转录本基因结构变异海拔

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    鸡骨柴及香薷属药用植物叶绿体基因组比较

    余潇宋雨茹赵振宁
    1420-1434页
    查看更多>>摘要：[目的]全面解析鸡骨柴(Elsholtzia fruticosa)的叶绿体全基因组序列与结构特征,探讨香薷属药用植物叶绿体基因组的整体特征与变异模式,比较序列的种间变异情况,筛选种间高变异序列,为香薷属药用植物叶绿体基因组的深入研究和应用奠定基础.[方法]以传统民族药用植物鸡骨柴为试验材料,采用高通量测序技术对鸡骨柴进行叶绿体基因组测序、组装和注释,同时利用生物信息学手段对4种香薷属药用植物(鸡骨柴、海州香薷、密花香薷、边山香薷)叶绿体基因组的反向重复区边界、结构同源性、基因密码子使用偏性参数、核苷酸组成及进化关系进行分析.[结果]①鸡骨柴叶绿体基因组全长151 550 bp,为典型四分体结构,共检测出49个简单重复序列(SSRs).②4种香薷属药用植物叶绿体基因组边界扩张收缩较为稳定相似,只在个别种(密花香薷、边山香薷)中发生了较小变异.③4种香薷属药用植物的非编码区变异大于编码区,同时大单拷贝区的变异程度最高,反向重复区a的变异程度最低.④相对于其它3个物种,鸡骨柴叶绿体基因组变异程度最低,psbA、petA、psbF、ycf1、petG和psbL等基因编码区存在显著差异,同时trnQ-UUG、trnS-GCT、trnM-GTT、trnS-GGA、trnL-CAA等基因间隔区也存在不同程度的变异.⑤4种香薷属药用植物叶绿体基因组密码子偏好性主要受碱基突变和选择压力的影响,最优密码子大多以A或T(U)作为第3位碱基.⑥系统发育树表明鸡骨柴与野拔子亲缘关系最近.[结论]本研究为香薷属药用植物的系统发育研究和分子标记开发等工作提供了参考依据.

    鸡骨柴香薷属叶绿体基因组特征密码子偏好性系统发育分析

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    基于SSR分子标记分析石阡茶树资源遗传多样性

    林开勤李悦欣魏杰汪安然...
    1435-1441页
    查看更多>>摘要：[目的]探明石阡茶树种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为开发和保护石阡茶树资源提供理论依据.[方法]利用SSR分子标记技术,对贵州石阡7个茶树群体122份资源进行SSR位点多态性、遗传多样性及亲缘关系分析,并对不同地域来源的石阡茶树资源进行遗传距离分析.[结果]21对SSR引物共扩增出72个多态性位点,每对引物平均扩增3.43个位点,多态信息含量(PIC)为0.19～0.76,平均为0.51,等位基因在群体中分布均匀且多态性较高.7个茶树群体的Nei's基因多样性指数(H)均值为0.22,Shannon信息指数(I)均值为0.33,多态位点百分率(PPB)均值为75％,遗传距离为0.0177～0.1036.122份石阡茶树资源的遗传距离为0.10～0.67,当遗传距离为0.21时,分为3个大类群:第I类群包含113份资源,第Ⅱ类群仅有1份茶树资源(SWXD009),第Ⅲ类群包含 8 份茶树资源,分别是 SWXD-B、SWXD-F、SWXD-H、SWXD-M、SQT3、SQT4、SWX005 和 SWX006;在 3 个大类群中均有五德镇长兴村的茶树资源.[结论]贵州石阡茶树群体间的遗传差异较小,但群体内个体单株之间具有一定的遗传差异,尤其是五德长兴茶树群体内的遗传背景较丰富,筛选优异资源的基础较好.

    茶树种质资源贵州石阡遗传多样性SSR分子标记

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    水稻种质资源茎杆抗倒伏性状的评价与分析

    王泓超凌波陈小玲谢展文...
    1442-1449页
    查看更多>>摘要：[目的]抗倒伏是当前水稻育种的重要关注性状,评价种质资源抗倒伏特性对培育抗倒品种具有重要意义.[方法]以国内200份种质资源为材料,系统调查9个与水稻抗倒伏相关性状,采用形态学聚类及通径分析,评价上述种质资源抗倒伏性状的育种价值.[结果]以倒伏指数为标准,将供试材料分为高抗倒型、抗倒型和倒伏型3种类型,其中81.5％的种质资源具有较好的抗倒能力.不同抗倒类型种质资源的茎秆物理性状与倒伏指数相关系数存在明显差异.如恢复系等材料的株高、弯曲力矩和基部第2节长与倒伏指数呈极显著正相关,其中弯曲力矩与倒伏指数的相关系数最高,达0.789;而基部抗折力、鞘叶厚度与倒伏指数呈负相关,相关系数分别为-0.754**和-0.659**.不育系的株高和基部第2节长与倒伏指数呈极显著正相关,其中株高与倒伏指数的相关系数达0.681**;基部抗折力与倒伏指数相关系数为-0.841**.通径分析表明,恢复系等材料的弯曲力矩对倒伏指数为直接正向效应(Py=0.519),不育系的株高对倒伏指数呈直接正向效应(Py=0.737),双亲基部抗折力对倒伏指数均呈直接负向效应,直接通径系数分别为-0.331和-0.702.[结论]水稻抗倒伏性状是一个复合性状,不同种质资源具有不同抗倒特性,科学利用育种资源是水稻抗倒伏育种的关键.

    水稻种质资源抗倒伏性状聚类分析通径分析

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    烟草品种和垄作对土壤小型节肢动物多样性的影响

    李治模于晓飞杨茂发杨相...
    1450-1458页
    查看更多>>摘要：[目的]探明烟田小环境变化对小型土壤节肢动物群落组成和多样性的影响,为筛选喀斯特植烟区的适栽品种与种植模式提供科学依据.[方法]2022年7月使用干漏斗法对贵州省凤岗县云烟87和K326种植区的小型土壤节肢动物群落组成和多样性进行调查,分析小型土壤节肢动物与烟田小环境(品种、种植模式及其交互作用)之间的关联性.[结果]调查共获得小型土壤节肢动物6纲16目70科.云烟87与K326小型土壤节肢动物群落组成差异明显,其中,K326垄体与垄沟的小型土壤节肢动物群落组成存在极显著差异,但云烟87无显著差异;K326垄体与云烟87垄体小型土壤节肢动物群落组成差异极显著,而K326垄沟和云烟87垄沟小型土壤节肢动物群落组成无显著差异.K326小型土壤节肢动物类群数、密度和Shannon指数(H')分别为4.18、5535.56和1.16,显著高于云烟87(2.12、1720.00和0.65),K326垄体小型土壤节肢动物类群数、密度和Shannon指数(H')分别为5.47、10520.00和1.40,显著高于垄沟(2.90、551.11和0.92),云烟87垄体小型土壤节肢动物仅密度(3000.00)显著高于垄沟(400.00),类群数和Shannon指数(H')无显著差异;云烟87垄体小型土壤节肢动物类群数、密度和Shannon指数(H')分别为1.97、3000.00和0.61,显著低于K326垄体(5.47、10 520.00和1.40),而云烟87和K326垄沟间小型土壤节肢动物类群数、密度和Shannon指数(H')无显著差异.[结论]垄作引起的微地形变化对小型土壤节肢动物的影响受烟草品种调控,垄体小型土壤节肢动物对烟草品种变化较垄沟更为敏感.

    垄沟垄体烟田小型土壤节肢动物多样性

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    冬播甘蓝型油菜生育期进程及生理生化特性

    王小霞刘自刚田海燕魏家萍...
    1459-1470页
    查看更多>>摘要：[目的]解决强冬性冬油菜/春油菜间杂交种生产花期不遇问题,为我国强冬性冬油菜和春油菜间杂种优势的利用提供依据.[方法]以强冬性甘蓝型冬油菜(NTS211、NTS304)和春油菜(C05、C19)为试验材料,10/11(月/日,下同)秋播甘蓝型强冬性冬油菜和春油菜;12/10、12/30、1/19、2/8、2/28冬播强冬性冬油菜和春油菜,记录生育期、出苗率和结实性能,并分析各生育期叶片生理生化特性.[结果]10/11秋播甘蓝型油菜越冬前出苗,强冬性冬油菜可以安全越冬,春性油菜越冬率为0;甘蓝型油菜在12/10后播种种子在越冬期不萌发,翌年早春3/21-4/6温度回暖后,种子陆续出苗,出苗率21.0％～72.3％.冬播冬油菜花期在6/21-7/5到7/3-7/20;冬播(12/10—翌年2/8)春油菜的花期在5/10-5/12到5/25-5/30;秋播冬油菜花期在5/5-5/6到5/30;秋播冬油菜和冬播(12/10—翌年2/8)春油菜花期相遇,1/19冬播春油菜和秋播冬油菜花期叠合时间最长(18 d).随着冬播时间推迟,冬播冬油菜花期进程延迟,生育期延长,冬播春油菜花期进程提早,生育期缩短;冬播冬油菜的结实性能呈下降趋势,冬播春油菜的千粒重呈上升趋势;冬播冬油菜和春油菜在苗期赤霉素含量呈上升趋势,在蕾薹期呈下降趋势,花期和角层期呈先上升后下降趋势;冬播冬油菜苗期的生长素含量显著高于春油菜;蕾薹期的过氧化物酶活性显著高于其余各生育期;冬油菜和春油菜的丙二醛含量在苗期最低,可溶性蛋白含量在花期最高.[结论]强冬性冬油菜秋播及春油菜冬播调解花期相遇可行,1/19冬播春油菜和秋播冬油菜花期叠合时间最长(18 d),冬播通过影响甘蓝型油菜叶片的抗氧化酶、丙二醛、渗透调节物质与内源激素,最终影响生长发育和结实性能.

    冬播甘蓝型油菜生育期花期调节生理特性

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    荫蔽及复光对大豆叶片光合性能和碳代谢的影响

    于晓波安建刚梁建秋杨文英...
    1471-1479页
    查看更多>>摘要：[目的]研究遮荫和复光下的大豆叶片性状、光合特性和碳代谢关键酶活性,明晰不同光环境和生长阶段大豆光合特性变化及其与碳代谢间的相互关系,为筛选和培育适宜套作的大豆品种提供依据.[方法]以强耐荫大豆品种南夏豆38和荫蔽敏感型大豆品种华夏5号为材料,在大田试验条件下采用绿色遮阳网进行模拟荫蔽的遮光处理,对荫蔽期和复光后的大豆叶片比叶重、单株叶面积、光合色素含量、光合特性参数、干物质分配以及叶片糖含量和碳代谢关键酶活性进行测定和分析.[结果]荫蔽期遮荫处理下大豆叶片比叶重、单株叶面积、光合色素含量和光合速率均显著下降,华夏5号降幅较南夏豆38更为明显;大豆干物质分配呈"茎增叶减"的变化趋势,南夏豆38的叶分配比例均显著高于华夏5号;叶片可溶性糖和蔗糖含量均显著下降,重度遮荫下蔗糖含量显著低于轻度遮荫,且华夏5号的降幅较南夏豆38更为明显;淀粉含量显著上升,华夏5号增幅大于南夏豆38,相同处理下华夏5号均显著高于南夏豆38;蔗糖合成酶(SS)、蔗糖磷酸合成酶(SPS)和蔗糖转化酶(Inv)均极显著下降,且重度遮荫下SS和Inv显著低于轻度遮荫,品种间相同遮荫处理下无显著差异.复光后,处理间叶片性状差异逐渐减小,干物质"茎增叶减"分配趋势的变化程度减弱;遮荫处理下淀粉含量均显著高于正常光照,南夏豆38的明显高于华夏5号;南夏豆38的SPS和Inv均显著高于华夏5号,重度遮荫处理下南夏豆38的SS显著高于华夏5号,且南夏豆38的恢复能力均好于华夏5号.[结论]遮荫降低大豆叶片比叶重和光合色素含量,光合速率和碳代谢关键酶活性下降,淀粉含量和茎干物质分配比例增加;复光后,叶片光合性能和酶活性快速恢复,干物质向叶分配增多.华夏5号对遮荫处理反应敏感,光合性能和酶活性降幅较大,南夏豆38在遮荫处理下能保持较好的光合性能,干物质分配相对合理,复光后光合性能及其碳代谢恢复性能力更强.

    大豆荫蔽叶片光合特性酶活性

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    果园生草对苹果叶片光合特性及果实品质的影响

    马仲炼马磊马永翠田虹...
    1480-1487页
    查看更多>>摘要：[目的]探究4种生草模式对苹果叶片光合特性和果实品质形成的影响,并筛选出适宜昭通果园的生草种类.[方法]以红富士为研究对象,设置果园清耕对照,探讨野艾蒿(Artemisia lavandulaefolia DC)、星毛繁缕(Stellaria vestita Kurz.)、黑麦草(Lolium perenne L.)以及白花车轴草(Trifolium repens Linn)种群对果树叶绿素含量、光合特性和果实品质的影响.[结果]白花车轴草处理可以提高叶片总叶绿素含量、净光合速率、胞间CO2浓度、气孔导度和羧化效率,而水分利用率显著降低;野艾蒿处理能增大叶片气孔导度,一定程度上提高胞间CO2浓度,总叶绿素含量和叶片羧化效率降低;星毛繁缕处理能提高胞间CO2浓度,但总叶绿素含量和叶片蒸腾速率降低;黑麦草处理可以显著提高水分利用率和叶片羧化效率,显著降低果树叶片蒸腾速率.品质方面,与清耕相比,各生草处理可使苹果的固形物含量增加0.88％～13.87％,还原糖含量降低2.30％～15.71％,总抗氧化能力增加10.03％～40.92％,黑麦草处理可使果实过氧化氢含量降低41.80％,超氧阴离子清除能力提高12.92％.利用模糊隶属函数法分析,清耕、白花车轴草、野艾蒿、星毛繁缕、黑麦草各处理综合评价值分别为0.4858、0.6044、0.5548、0.4894、0.6059.[结论]不同的草种种群在一定程度上提高果树叶片光合能力,改善果实品质,对4种草种种群进行科学评价,有益于筛选出更为合理的果园生草类型.

    昭通苹果果园生草草种光合特性品质

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    基于改进组合赋权法和VIKOR法的茄芯烟叶化学品质评价

    张勇刚任志广刘建国赵程虹...
    1488-1493页
    查看更多>>摘要：[目的]探讨改进组合赋权法与多准则妥协解排序法(VIKOR)相结合开展茄芯化学品质评价,以期丰富雪茄烟叶质量评价方法.[方法]以云南茄芯烟叶化学成分为研究对象,引入变异系数和复相关系数改进传统CRITIC法(Criteria importance through inter-criteria correlation),采用 e0/4～e8/4 标度取代层次分析法(Analytic hierarchy process,AHP)中的 1～9 标度,并基于博弈论计算组合权重,利用无权重个体遗憾值改进的VIKOR法开展茄芯化学品质评价.[结果]与传统CRITIC法确定的化学成分指标权重相比,改进CRITIC法中钾的权重提升1.09倍,还原糖指标权重降低45.26％;e0/4～e8/4标度与1～9标度AHP法确权结果相比,权重大小排序一致,不同化学成分指标间权重的差异减小;改进VIKOR法与传统方法对茄芯化学品质的排序结果具有较高的一致性,但也存在不可忽略的差异,说明有必要在个体遗憾值中考虑权重的影响.[结论]改进CRITIC法能够解决传统方法确权受计量单位和正负向指标影响的问题,AHP法中通过标度的替代显著提升判断矩阵的一致性,无权重个体遗憾值条件下的VIKOR法在综合考虑化学品质整体表现的同时,突显了表现较差的化学成分指标的作用,评价结果相对合理.

    茄芯复相关系数e0/4～e8/4标度CRITICVIKOR无权重个体遗憾值

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