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中国病毒病杂志
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中国病毒病杂志/CSTPCD
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    全国疾病预防控制行动方案(2024-2025年)(第二部分)

    国家疾病预防控制局十部门
    259页
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    H5N8高致病性禽流感病毒HA蛋白T细胞抗原表位的预测

    杨亚龙杨森姚树森徐风华...
    260-266页
    查看更多>>摘要：目的 利用生物信息学方法对H5N8高致病性禽流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)蛋白的T细胞的优势抗原表位进行预测,探索高致病性禽流感抗原表位快速预测方法.方法 以甲型流感病毒[A/chicken/Moscow/94/2017(H5N8),ID:ATE48581.1]为原始毒株,从GenBank数据库中获取其血凝素(hemagglutinin,HA)蛋白的氨基酸序列,综合应用多个生物信息学工具对HA蛋白潜在的细胞毒性T细胞(cytotoxic T lymphocyte,CTL)表位和辅助 T细胞(helper T lymphocyte,HTL)表位进行预测.结果 H5N8高致病性禽流感病毒的HA蛋白保守性较高,44条不同病毒株HA蛋白可以装进同一系统进化枝.经预测,HA蛋白的一级、二级结构明确,三级结构模型可信度高,构象合理.最终筛选到具有免疫原性且抗原性较好、无致敏性、无毒性的CTL表位8条,筛选到抗原性较好、无致敏性、无毒性、能诱导γ-干扰素(interferon-y,IFN-γ)、白介素4(interleukin 4,IL-4)分泌的HTL表位8条.预测的16条表位在不同的44条H5N8蛋白序列之间的保守性最好,在10条H5N6的HA蛋白序列之间的保守性次之,在13条H5N1的HA蛋白序列之间保守性较差.结论 通过本研究的预测流程可以快速筛选出HA蛋白的CTL表位和HTL抗原表位,为快速高效研发新型重组多肽流感疫苗提供了技术路线和理论参考.

    生物信息学多肽疫苗CTL候选表位HTL候选表位H5N8血凝素

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    持续抗病毒治疗5年以上人类免疫缺陷病毒感染者代谢特征研究

    阿力亚·阿迪力努尔徐冰钰李月飞何倩...
    267-273页
    查看更多>>摘要：目的 检测人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)感染者持续抗反转录病毒治疗(anti-retroviraltherapy,ART)后体内代谢物变化,分析长期接受ART的HIV感染者的代谢特征,为改善和优化ART提供数据支持.方法 2022年7月在新疆伊宁市招募持续接受ART 5年以上的HIV感染者23例(治疗组)、从未接受ART的HIV感染者20例(未治疗组)及健康对照组24例.收集3组人群外周静脉血样本,进行CD4+T淋巴细胞(CD4+T细胞)计数和病毒载量(viral load,VL)检测,通过液质联用技术对血浆样本进行非靶向代谢组学检测,采用主成分分析(principal component analysis,PCA)、偏最小二乘法判别分析(partial least squares discriminant analysis,PLS-DA)筛选差异代谢物,比较3组人群间代谢物的差异.结果 在治疗组、未治组及健康对照组血浆样本中共鉴定代谢物1 028种,按照投影重要度(variable impor-tance for the projection,VIP)＞1.0,差异倍数(fold change,FC)＞1.2 或 FC＜0.833 且 P＜0.05 的标准筛选差异代谢物,发现126种代谢物显著改变并参与HIV感染者代谢的病理生理过程.结果 显示,与健康对照组比较,治疗组甘氨鹅脱氧胆酸等42种代谢物表达上调,褪黑素、雌三醇、前列腺素E2等84种代谢物表达下调,涉及多不饱和脂肪酸代谢等多种代谢通路的改变;未治疗组37种代谢物显著上调,73种代谢物显著下调,并在初级胆汁酸代谢通路富集,提示可能存在胆汁酸累积造成的肝毒性.治疗组与未治疗组比较,细辛醛等11种代谢物显著上调,犬尿喹啉酸等19种代谢物显著下调,表明色氨酸代谢通路在其中发挥重要作用.结论 长期ART引起的褪黑素、前列腺素E2等代谢物的改变提示持续ART有助于维持HIV感染者的免疫重建.因此,密切关注HIV感染者和艾滋病患者的代谢特征变化,及时调整其用药方案,具有重要意义.

    人类免疫缺陷病毒-1艾滋病抗反转录病毒治疗非靶向代谢组学代谢物治疗

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    重组酶介导等温扩增-CRISPR/Cas13a结合侧流层析技术快速检测猴痘病毒

    杨宁马君妍孟子欣蓉赵康辰...
    274-281页
    查看更多>>摘要：目的 基于重组酶介导的等温扩增技术(recombinase aided amplification,RAA)和规则成簇间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)-Cas13a(CRISPR-associated protein 13a)结合侧流层析技术(lateral flow assay,LFA)建立一种快速、灵敏、特异的猴痘病毒(monkeypox virus,MPXV)检测方法.方法 针对MPXV的F3L段基因设计其RAA扩增引物、CRISPR RNA(crRNA)、荧光报告探针及LFA探针,对反应条件进行优化,建立RAA-CRISPR/Cas13a-LFA检测体系,评价该体系的检测灵敏度与特异性,并与实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)检测结果进行一致性比较,同时应用实际临床样本验证该检测体系的准确性.结果 RAA-CRISPR/Cas13a-LFA检测体系可以在60 min内(包括实验操作)完成检测,该体系对病毒DNA的检出限为18拷贝/反应;特异性试验表明其与水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus,VZV)、单纯疱疹病毒(herpes simplex vi-rus,HSV)、EB 病毒(Epstein-Barr virus,EBV)、柯萨奇病毒 A16 型(CVA16)、肠道病毒 A 组 71 型(EV-A71)、麻疹病毒(measles virus,MeV)均无交叉反应;临床样本检测结果表明,RAA-CRISPR/Cas13a-LFA与qPCR法之间的差异无统计学意义,二者具有良好的检测一致性(Kappa=0.892).RAA-CRISPR/Cas13a-LFA检测体系的灵敏度和特异度分别为100.0％和83.3％,阳性预测值为96.6％,阴性预测值为100.0％.结论 建立的RAA-CRISPR/Cas13a-LFA检测体系可快速、灵敏、特异地检测MPXV.

    重组酶介导的等温扩增技术CRISPR-Cas13侧流层析技术猴痘病毒检测

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    全国疾病预防控制行动方案(2024-2025年)(第三部分)

    国家疾病预防控制局十部门
    281页
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    2株人副肠孤病毒1型山东地方株的全基因组序列分析

    王倩刘尧林小娟陶泽新...
    282-288页
    查看更多>>摘要：目的 了解人副肠孤病毒1型(human parechovirus 1,HPeV1)山东地方株的遗传背景和进化特征,为国内HPeV的流行病学调查及预防提供科学依据.方法 山东省疾病预防控制中心脊髓灰质炎实验室对来自2019年和2021年山东省急性弛缓性麻痹监测系统报告病例的1319份粪便标本按照监测方案要求进行病毒分离,病毒分离物应用下一代测序技术测定其全基因组序列.使用BioEdit 7.0.9.0软件进行同源性分析,使用MEGA 11.0软件构建系统发生树,使用SimPlot 3.5.1软件进行重组分析.结果 成功分离到2株HPeV1(19225和21031),其基因组全长分别为7 324 nt和7 328 nt(未包括多聚腺苷酸尾),编码区长6 540 nt,可编码一个含2 179个氨基酸的多聚蛋白,衣壳蛋白VP1羧基端含有精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸基序.2株山东分离株间的核苷酸同源性为91.4％,与国内外其他地区HPeV1分离株的核苷酸同源性为77.3％～95.4％.VP1区系统发生分析结果显示,山东分离株位于HPeV1B基因簇内,与其他地区HPeV1分离株的平均遗传距离为0.153.重组分析结果显示,21031株在3C和3D区与HPeV5毒株CH-ZXY1存在重组信号,19225株不存在基因重组现象.结论 山东地方株与国内外其他HPeV1分离株存在不同程度的序列变异,研究结果为HPeV的基因组流行病学研究和诊断试剂研发提供了科学依据.

    人副肠孤病毒1型下一代测序全基因组系统发生学分析重组分析

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    北京市朝阳区6～35月龄婴幼儿新型冠状病毒感染情况及疫苗接种意愿调查

    黄立勇王淑瑜邹心宇蓝秋凤...
    289-292页
    查看更多>>摘要：目的 了解北京市朝阳区6～35月龄婴幼儿新型冠状病毒(简称新冠病毒)感染基本情况以及其法定监护人为其接种各种类型新冠病毒疫苗的意向.方法 2023年6月27日-7月10日,在朝阳区4家社区卫生服务中心和1家三级甲等儿童专科医院门诊进行疫苗接种和因病就诊的人群中,选取满6～35月龄的婴幼儿监护人进行现场问卷调查,描述性分析婴幼儿新冠病毒感染情况及新冠病毒疫苗的接种意愿.结果 本研究共调查6～35月龄婴幼儿385人,新冠病毒感染率为82.86％(319/385),感染高峰时间在2022年12月和 2023 年 5 月;发热(308/317,97.16％)、咳嗽(129/317,40.69％)、活动减少(110/317,34.70％)和流涕(109/317,34.38％)是最常见的症状,其中咳嗽和流涕持续时间中位天数分别为4 d和3 d;再次感染率为12.23％(39/319),两次感染间隔时间中位天数为152 d.39例再次感染者与其首次感染相比,再次感染时发热症状比例降低10.26％(4/39),但是咳嗽(6/39,15.38％)、流涕(4/39,10.26％)、鼻塞和呕吐(4/39,10.26％)症状出现比例依次升高.如果国内推荐6月龄以上婴幼儿接种新冠病毒疫苗,56.88％(219/385)的儿童监护人不愿意接种,最主要原因是担心疫苗不良反应(101/219,46.12％).结论 6～35月龄婴幼儿新型冠状病毒感染率较高.与首次感染相比,再次感染后,暂未发现重症比例升高现象.监护人未来为婴幼儿接种新冠病毒疫苗的意愿不高.

    新型冠状病毒婴幼儿感染疫苗接种意愿

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    中国4款未纳入国家免疫规划疫苗针对疾病负担及应用情况分析

    随海田赵若颖郭昱苏峰...
    293-300页
    查看更多>>摘要：截至目前我国国家免疫规划共纳入14种疫苗,可覆盖15种相关疾病.然而,国家免疫规划近15年未引进新的疫苗,只对部分疫苗接种剂次进行了微调,维持了多年"14苗防15病"的现状.目前,世界卫生组织推荐纳入国家免疫规划的疫苗共10种,我国尚有4种未纳入,包括b型流感嗜血杆菌疫苗、肺炎球菌疫苗、轮状病毒疫苗和人乳头瘤病毒疫苗.b型流感嗜血杆菌、肺炎球菌、轮状病毒和人乳头瘤病毒在我国引起的疾病负担仍然很重,应进一步加强对疾病的监测,评估疾病发生所带来的疾病负担和经济负担,同时开展疫苗接种效果评估,评估疫苗纳入免疫规划的可行性,为进一步把4种疫苗纳入国家免疫规划提供更多的数据支持.

    国家免疫规划b型流感嗜血杆菌肺炎球菌轮状病毒人乳头瘤病毒

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    全国疾病预防控制行动方案(2024-2025年)(第四部分)

    国家疾病预防控制局十部门
    300页
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    《中国病毒病杂志》稿约

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