查看更多>>摘要:目的 对青少年特发性脊柱侧凸(adolescent idiopathic scoliosis,AIS)患者间质干细胞的基因芯片数据进行生物信息学分析,探究AIS致病机制和治疗靶点.方法 从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)下载基因芯片GSE110359,获取AIS患者与非AIS患者间质干细胞中的基因表达谱.利用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)识别AIS关键模块,并对其进行基因本体(gene ontology,GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析;同时,对其 28 种不同类型免疫细胞进行免疫细胞浸润分析和蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,并筛选出核心基因.结果 确定 8 个基因共表达模块,GO富集在对氧减少的反应水平、低氧反应、对氧水平的反应、核糖核蛋白复杂组装、胶原蛋白-包含细胞外基质、剪接体snRNP复合物、snRNA结合、细胞外基质结构组成,KEGG信号通路富集在低氧诱导因子-1 信号通路、剪接体、细胞铁死亡、脂肪酸降解等通路.此外,免疫浸润结果发现,AIS 组单核细胞较非AIS组明显减少(P<0.05);而AIS组的活化树突状细胞浸润程度更高(P<0.05),通过PPI分析,筛选出血管生成素样4(angiopoietin-like 4,ANGPTL4)、CXC基序趋化因子配体 8(C-X-C motif chemokine ligand 8,CXCL8)、溶质载体家族 2 成员 1(solute carrier family 2 member 1,SLC2A1)、己糖激酶 2(hexokinase 2,HK2)、转铁蛋白受体蛋白(transferrin receptor protein,TFRC)在内的 5 个核心基因.结论 ANGPTL4、CXCL8、SLC2A1、HK2、TFRC是AIS患者的潜在生物标志物与治疗靶点,而单核细胞和活化树突状细胞可能是AIS患者的重要免疫治疗靶点.