嗜酸乳杆菌NCFM双精氨酸分泌信号肽蛋白的预测分析
Prediction Analysis of Signal Peptide Proteins of Twin-Arginine Translocation Pathway in Lactobacillus acidophilus NCFM
朱德全 1王茗悦 2姚嘉 3张跃华 1韩诚武 2卢伟 3栾积毅 3刘向东3
作者信息
- 1. 佳木斯大学理学院,黑龙江佳木斯 154007
- 2. 佳木斯大学生命科学学院,黑龙江佳木斯 154007
- 3. 佳木斯大学机械工程学院,黑龙江佳木斯 154007
- 折叠
摘要
[目的] 对嗜酸乳杆菌NCFM中Tat途径分泌信号肽蛋白进行预测分析.[方法] 以嗜酸乳杆菌NCFM基因组序列为对象,采用SignalP4.0、LipoP1.0、TatP 软件分析该菌株基因组中的双精氨酸途径分泌信号肽蛋白.[结果] 嗜酸乳杆菌NCFM中有酶切位点也有motif的Tat途径信号肽蛋白94个.[结论] 对嗜酸乳杆菌NCFM中Tat途径分泌信号肽蛋白的预测分析,为进一步分析该菌胞外蛋白的分泌机制打下基础.
Abstract
[Objective] To predict their signal peptide proteins secreted by Tat pathway in Lactobacillus acidophilus NCFM.[Method] The genome sequences of L.acidophilus NCFM were used to predict to secretory proteins of Tat pathway and functional analysis by using SignalP4.0,LipoP1.0,TatP.[Result] There were 94 proteins containing cleavage site of enzyme and motif of Tat pathway in L.acidophilus NCFM.[Conclusion] These results lay the foundation for analyzing the secretion mechanism of extracellular protein in L.acidophilus NCFM.
关键词
嗜酸乳杆菌NCFM/基因组/信号肽蛋白/Tat分泌途径Key words
Lactobacillus acidophilus NCFM/Genome/Signal peptide proteins/Tat secretion pathway引用本文复制引用
基金项目
黑龙江省卫生计生委科研项目(2016-325)
佳木斯大学科技创新团队项目(cxtd-2016-02)
出版年
2017
国家科技期刊平台
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