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核酸染色剂对DNA在琼脂糖凝胶电泳中迁移速度的影响

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核酸染色应用在许多DNA检测相关的技术领域,然而染色剂结合DNA会造成电泳迟滞.为研究溴化乙锭(ethidium bromide,EB)和GelRed这2种核酸染色剂对DNA在琼脂糖凝胶电泳中迁移速度的影响,分别用这2种染色剂采用前、后染色的方法对DNA进行染色,以琼脂糖凝胶电泳作为检测方法,凝胶成像系统拍照观察,用Reptation理论分析数据.研究结果表明EB和GelRed染色均使DNA迁移发生了滞后,但EB对于目的基因片段大小的判读未受电泳滞后的影响,而GelRed对目的基因判读略有影响.然而,与EB相比,GelRed具有荧光效果强、安全、环保等诸多优点.总之,需要精确鉴定目的基因片段大小可以选择后染色或EB前染色,对于鉴定目的基因片段大小要求不高且需要荧光效果好、环保的染色剂可以选择GelRed.
Effect of Nucleic Acid Dye on Migration Velocity of DNA Fragments in Agarose Gel Electrophoresis

薄秀梅

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徐州医科大学基础医学院国家级基础医学实验教学示范中心,江苏徐州221004

EB GelRed 迁移速度 琼脂糖凝胶电泳

国家自然科学基金

81100852

2020

安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子:0.413
ISSN:0517-6611
年,卷(期):2020.48(3)
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