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阿拉伯岩芥AP2基因家族的生物信息学分析

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AP2基因作为一种调控植物花发育的功能基因,参与花分生特性建立.利用生物信息学方法对阿拉伯岩芥AP2蛋白的理化性质、高级结构和系统进化关系等进行了详细的预测和分析.结果 表明,除了成员AA40G00375、AA54G00162为稳定蛋白,其余AP2蛋白均为不稳定蛋白,且大多数蛋白定位在细胞核.只有成员AA8G00350属于分泌蛋白,其余均为非分泌蛋白,且均不属于跨膜蛋白.磷酸化位点分析表明AP2蛋白的生物功能主要是通过在丝氨酸(Ser)位点进行磷酸化来实现的.AP2蛋白的二级结构以无规则卷曲为主,各个成员的二级结构元件组成含量大小排列顺序为无规则卷曲>α-螺旋>延伸链>β-转角.其中14个AP2蛋白成员有2个保守结构域,其余均有1个保守结构域.系统进化树表明阿拉伯岩芥AP2基因家族与拟南芥、小麦有较近的亲缘关系.这些结果可为进一步研究其生物学功能提供一定的参考依据.
Bioinformatics Analysis of AP2 Gene Family in Aethionema arabicum

付春、刘晓伟、王玲、江纳、杨瑶君

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乐山师范学院竹类病虫防控与资源开发四川省重点实验室,四川乐山614000

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阿拉伯岩芥 AP2基因 生物信息学

四川省科技厅项目乐山师范学院人才启动项目

17ZZ019XJR17005

2020

安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子:0.413
ISSN:0517-6611
年,卷(期):2020.48(8)
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