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基于益生菌调节的太平鸡回肠SNP位点分析

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为挖掘益生菌调节下太平鸡回肠SNP位点,将120只太平鸡随机分为对照组与益生菌组,采用高通量测序技术对太平鸡回肠转录组的SNP位点进行分析.结果显示:SNP类型中,转换类型明显高于颠换类型,对照组中转换类型占22.55％～27.45％,颠换类型占11.43％～13.87％;益生菌组与对照组结果相似,转换类型(22.53％～27.46％)明显高于颠换类型(11.37％～13.94％).SNP位置分析表明,对照组和益生菌组总SNP位点分别为4684072和4647171个,其中位于内含子和基因间区的SNP位点最多.另外,在SNP功能分析中,同义突变SNP占比最高,在对照组和益生菌组中分别占7.01％和7.10％;非同义突变SNP在对照组和益生菌组中占比分别为2.97％和2.98％.该研究结果可为今后太平鸡的分子标记开发、遗传连锁图谱构建以及辅助育种等提供基础数据.
SNP Site Analysis of Taiping Chicken Ileum Based on Probiotic Regulation

雒林通、马芳、唐德富、包晓娟

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天水师范学院生物工程与技术学院,甘肃天水741001

甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃兰州730070

太平鸡 益生菌 回肠 转录组测序 SNP

甘肃省民生科技计划项目天水市科技支撑计划项目

1503FCME0052020-SHFZKJK-7879

2020

10.3969/j.issn.0517-6611.2020.21.023

安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413
ISSN：0517-6611
年,卷(期)：2020.48(21)
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