安徽农业科学2021,Vol.49Issue(9) :104-108,112.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2021.09.026

苹果矮化中间砧"SH6"中GID2基因的克隆及生物信息学分析

Cloning and Bioinformatics Analysis of GID2 Gene in Apple Dwarfing Interstock"SH6"

王恩莹 晁琳珂 郝素晓 卢艳芬 姚允聪
安徽农业科学2021,Vol.49Issue(9) :104-108,112.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2021.09.026

苹果矮化中间砧"SH6"中GID2基因的克隆及生物信息学分析

Cloning and Bioinformatics Analysis of GID2 Gene in Apple Dwarfing Interstock"SH6"

王恩莹 1晁琳珂 1郝素晓 1卢艳芬 1姚允聪1
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作者信息

  • 1. 北京农学院植物科学技术学院/农业应用新技术北京重点实验室,北京102206
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摘要

探究GID2基因在调控植物生长发育方面的作用机制.从苹果矮化砧木"SH6"中克隆到GID2-1和GID2-2基因,运用MEGA7、SWISS-MODEL、DNAMAN 7.0等生物信息学工具分析其序列、蛋白质结构;通过qRT-PCR分析GID2-1和GID2-2基因在不同激素处理下的表达情况.序列分析表明,GID2-1基因的CDS序列长度为591 bp,GID2-2为597 bp,分别编码196、198个氨基酸的蛋白质;GID2基因具有F-box结构域.qRT-PCR分析表明,在GA处理下,表达量下调;相反,在PAC处理下其表达量上调.结果表明,GID2基因可能在苹果生长发育方面发挥重要作用.

关键词

SH6/GID2/生长发育/生物信息学/赤霉素

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基金项目

国家自然科学基金(31872081)

2018年北京市农业应用新技术重点实验室开放项目(KF2018023)

2019年北京农学院学位与研究生教育改革与发展项目(2019YJS039)

出版年

2021
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子:0.413
ISSN:0517-6611
参考文献量6
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