安徽农业科学2021,Vol.49Issue(13) :103-107.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2021.13.025

基于转录组的金花茶PEBP基因家族的鉴定及分析

Transcriptome-wide Identification and Expression Profiling of PEBP Gene Family in Camellia nitidissima

刘合霞 刁慧玲 舒杨 谭肖玲 韦晓晓 李妍 龙开芸 苏雅萍 赵娇妹 李博
安徽农业科学2021,Vol.49Issue(13) :103-107.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2021.13.025

基于转录组的金花茶PEBP基因家族的鉴定及分析

Transcriptome-wide Identification and Expression Profiling of PEBP Gene Family in Camellia nitidissima

刘合霞 1刁慧玲 1舒杨 1谭肖玲 1韦晓晓 1李妍 1龙开芸 1苏雅萍 1赵娇妹 1李博1
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作者信息

  • 1. 玉林师范学院生物与制药学院,广西玉林537000
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摘要

磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidyl ethanolamine binding protein,PEBP)在花的形态建成中具有重要作用,为了解该基因家族在金花茶开花过程中的调控作用,通过对金花茶的花瓣转录组测序数据进行生物信息学分析,从转录组数据库中筛选金花茶(Camellia ni-tidissima)PEBP基因,并对其蛋白质性质、功能结构域、进化关系及开花过程中的表达模式进行了分析.结果表明,金花茶花瓣转录组中共含有9个PEBP基因家族成员,可以分为FT-like、TFL1-like、MFT-like、PEBP-like 4个亚基因家族;该蛋白家族主要由酸性、亲水的稳定蛋白构成,定位于细胞核中;该基因家族Motif具有一定的保守型,且所包含的保守基序数目及种类存在一定差异.在金花茶开花过程中,CnPEBP 4基因的表达量不断增高,该基因可能对金花茶花瓣形态建成具有一定的调控作用;而其他基因家族成员在金花茶花瓣组织中表达量较低或不表达.鉴定获得了金花茶PEBP基因家族成员的序列和部分功能信息,为研究金花茶开花调控提供了理论参考,为金花茶开花调控机理的研究奠定基础.

关键词

PEBP基因家族/金花茶/保守基序/进化分析/表达量分析

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基金项目

出版年

2021
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子:0.413
ISSN:0517-6611
被引量1
参考文献量12
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