安徽农业科学2022，Vol.50Issue(13) ：93-97.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2022.13.025

云南原始地方种四路糯基因组中的MITE类转座子"124"

The MITE Transposon"124"in the Genome of Yunnan Original Landrace Four-Row Wax

武晓阳 杨亚洲 隆文杰 陈丹 周国雁 杜娟 伍少云 蔡青 黄兴奇
安徽农业科学2022，Vol.50Issue(13) ：93-97.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2022.13.025
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云南原始地方种四路糯基因组中的MITE类转座子"124"

The MITE Transposon"124"in the Genome of Yunnan Original Landrace Four-Row Wax

武晓阳 1杨亚洲 2隆文杰 3陈丹 3周国雁 3杜娟 3伍少云 3蔡青 3黄兴奇1
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作者信息

  • 1. 云南大学生命科学学院,云南昆明650091;云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所,云南昆明 650223
  • 2. 中国种子集团有限公司生命科学技术中心,湖北武汉430206
  • 3. 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所,云南昆明 650223
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摘要

[目的]研究四路糯与普通玉米之间的亲缘关系.[方法]比较四路糯与B73基因组中"124"转座子的构成差异.[结果]在B73基因组中鉴定出13个"124"转座子序列和其插入位点信息;通过重测序得到约120 Gb的四路糯基因组序列,并从中鉴定出17个"124"转座子序列和其插入位点信息;在二者基因组中存在3个共同的"124"插入位点,这些位点展示出"124"转座子在序列和插入位点一致;B73基因组和四路糯基因组中均存在与waxy基因中"124"一致的转座子序列;建立的系统进化树可将"124"转座子归为4种类型,其中并没有单一基因组来源的类型.[结论]四路糯与B73基因组的差异是玉米种内的差异.

关键词

糯玉米地方品种/四路糯/重测序/"124"转座子/起源演化

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基金项目

国家自然科学基金(32060459)

云南省博士后定向培养资助项目(云人社通[2018]168号)

科技部财政部国家科技资源共享服务平台项目国家作物种质资源库课题(NCGRC-2020-030)

生物资源数字化开发应用项目(202002AA100007)

出版年

2022
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413
ISSN：0517-6611
参考文献量10
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