安徽农业科学2022,Vol.50Issue(19) :102-105.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2022.19.024

骆马湖国家级水产种质资源保护区20种鱼类的COI条形码构建和分析

Construction and Analysis of COI Barcode of Twenty Fishes in National Aquatic Germplasm Resources Protection District of Luoma Lake

李大命 刘洋 刘燕山 张彤晴 殷稼雯 张伟 穆新武 蒋琦辰
安徽农业科学2022,Vol.50Issue(19) :102-105.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2022.19.024

骆马湖国家级水产种质资源保护区20种鱼类的COI条形码构建和分析

Construction and Analysis of COI Barcode of Twenty Fishes in National Aquatic Germplasm Resources Protection District of Luoma Lake

李大命 1刘洋 2刘燕山 1张彤晴 1殷稼雯 1张伟 3穆新武 3蒋琦辰1
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作者信息

  • 1. 江苏省淡水水产研究所,江苏省内陆水域渔业资源重点实验室,江苏南京 210017
  • 2. 江苏省淡水水产研究所,江苏省内陆水域渔业资源重点实验室,江苏南京 210017;南京师范大学海洋科学与工程学院,江苏南京 210046
  • 3. 江苏省骆马湖渔业管理委员会办公室,江苏宿迁 223800
  • 折叠

摘要

通过PCR扩增和测序,获得骆马湖国家级水产种质资源保护区20种鱼类的201条线粒体COI条形码,并对20种鱼类的COI条形码进行分析.结果显示,COI基因序列碱基的平均含量分别为A 24.4%、C 28.3%、T 28.5%和G 18.8%,碱基AT含量(52.9%)大于GC含量(47.1%).20种鱼类的种内和种间遗传距离分别为0~0.0177和0.0080~0.3088,遗传距离平均值分别为0.0029和0.2025,种间遗传距离为种内遗传距离的69.8倍.科内属间、目内科间和目间的遗传距离分别为0.1503、0.2061和0.2364,表明遗传距离随着分类界元上升有增加趋势.分子系统学分析结果显示,20种鱼类在系统进化树上均为单系,与形态学分类结果一致.该研究首次构建了骆马湖国家级水产种质资源保护区20种鱼类的COI条形码,可为保护区渔业资源管理及生物多样性保护提供科学依据.

关键词

DNA条形码/COI基因/遗传距离/物种鉴定/骆马湖

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基金项目

江苏省农业科技自主创新项目(CX213003)

江苏省水生生物资源重大专项(ZYHB16-3)

省级单位农业项目(2019)(2019-SJ-018-2)

出版年

2022
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子:0.413
ISSN:0517-6611
参考文献量17
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