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基于转录组技术的枫叶鲑亲本鉴定和杂交优势分析

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为探究枫叶鲑的亲本来源及杂种抗病优势,采用Illumina高通量测序技术对枫叶鲑的胸腺和头肾组织转录组进行测序分析.结果获得胸腺组织原始数据8224345800 bp,拼接获得169204条单基因序列(Unigene);头肾组织原始数据7409864400 bp,拼接获得132292条Unigene.利用生物信息学方法对Unigene进行NR库相似搜索,还进行了GO、KOG和KEGG分类注释.通过比对线粒体DNA(mtDNA)基因序列发现,枫叶鲑与虹鳟(Oncorhynchus mykiss)的线粒体基因同源性达99％以上,可判定枫叶鲑母本是虹鳟;E3、TNF-α、IGM等基因的同源性在大鳞大麻哈鱼(Oncorhynchus tshawytscha)中比虹鳟高,推测枫叶鲑父本可能是大鳞大麻哈鱼.对免疫相关基因分析发现,IgM、TNF-α和T、B淋巴细胞相关基因序列与父、母本同源性均较高,因此初步判定枫叶鲑抗病优势是父、母本双方杂交的结果.通过转录组分析杂交种的抗病优势存在盲区,但该技术可以快速判断父、母本的来源,获得大量遗传信息,优势明显.
Parental Identification and Hybrid Vigor Analysis of Maple Salmon Based on Transcriptome Technology

刘玉猛、蒋洁兰、毛明光、朱诗裕、王伟

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大连海洋大学海洋科技与环境学院,辽宁大连 116023

海南热带海洋学院崖州湾创新研究院,海南三亚 572024

海南热带海洋学院/海南热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室,海南三亚 572022

枫叶鲑 转录组 亲本鉴定 抗病优势分析

海南热带海洋学院崖州湾创新研究院开放课题海南省自然科学基金海南省自然科学基金海南热带海洋学院引进人才科研启动资助项目海南热带海洋学院引进人才科研启动资助项目

2022CXYK-FKT06322RC716422MS083RHDRC202119RHDRC202206

2023

10.3969/j.issn.0517-6611.2023.01.021

安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413
ISSN：0517-6611
年,卷(期)：2023.51(1)
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