安徽农业科学2023，Vol.51Issue(3) ：89-95.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.03.020

基于Cytb基因的穿山甲科物种鉴定研究

Species Identification for Pangolins Based on Cytochrome b Gene

王辰 杨娅富 李立 逯金瑶 李嘉昊 李波
安徽农业科学2023，Vol.51Issue(3) ：89-95.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.03.020
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基于Cytb基因的穿山甲科物种鉴定研究

Species Identification for Pangolins Based on Cytochrome b Gene

王辰 1杨娅富 1李立 2逯金瑶 2李嘉昊 1李波3
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作者信息

  • 1. 东北林业大学野生动物与自然保护地学院,黑龙江哈尔滨150040
  • 2. 湖南省生物多样性保护中心,湖南长沙 410000
  • 3. 东北林业大学野生动物与自然保护地学院,黑龙江哈尔滨150040;国家林业和草原局野生动植物检测中心,黑龙江哈尔滨 150040
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摘要

为鉴别混有非穿山甲物种疑似检材的来源物种,基于细胞色素b基因设计了穿山甲科特异的新引物DCW-F1/DCW-R1.试验表明:其特异性良好、灵敏度较高、适用检材类型较广.采用BLAST比对法、遗传距离法和系统发育法分析了4组不同长度Cytb序列,研究序列长度对穿山甲物种鉴定的影响.结果表明,多数样本与相应穿山甲物种同源序列相似度均高于98％,建议将该值作为BLAST比对法的判别标准;除马来穿山甲(211 bp)和树穿山甲(421和211 bp)外,剩余5个穿山甲物种种间最小遗传距离均大于种内最大遗传距离,序列长度的变化和样本量的不平衡会导致该比值不稳定;除马来穿山甲和菲律宾穿山甲,其余物种均为单系,序列长度变短使得系统发育树拓扑结构和分支置信度发生相应变化.

关键词

物种鉴定/穿山甲/细胞色素b基因(Cytb)/序列分析

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基金项目

珍稀濒危物种调查监管与行业规范项目(2020070209-4)

湖南省林业科技创新计划项目(XLK201915)

出版年

2023
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413
ISSN：0517-6611
参考文献量12
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