18种观赏植物F3′5′H基因生物信息学分析

Bioinformatical Analysis of Flavonoid-3′5′-Hydroxylase Genes Originated from 18 Ornamental Plants

曾慧兰 ¹高阳 ²卢毅²

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作者信息

1. 宜春学院生命科学与资源环境学院,江西宜春336000;江西省作物生长发育与调控重点实验室,江西宜春336000
2. 宜春学院生命科学与资源环境学院,江西宜春336000
折叠

摘要

采用生物信息学方法对18种观赏植物类黄酮-3′5′-羟化酶基因(flavonoid-3′5′-hydroxylase,F3′5′H)的mRNA和氨基酸序列的理化性质、跨膜结构域、保守结构域、亚细胞定位、二级结构、三级结构和同源性进行预测与分析.结果表明,绝大多数观赏植物的F3′5′H为亲水性稳定蛋白质,以α螺旋为主、无信号肽的跨膜蛋白质;大多数定位于内质网膜上;其三级结构模型为5ylw.1.A铁锈醇合成酶,为单链蛋白,属于细胞色素P450基因家族;同源保守氨基酸序列为"LPPGP""AGTDTS"和"PFGAGRRICAG".

关键词

生物信息学/观赏植物/氨基酸序列/类黄酮-3′5′-羟化酶

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基金项目

江西省作物生长发育调控实验室开放课题(KFJJ-201704)

宜春学院博士科研启动项目(2103360117013)

出版年

2023

安徽农业科学

安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413

ISSN：0517-6611

参考文献量7

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