安徽农业科学2023,Vol.51Issue(9) :160-163.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.09.039

雪胆属转录组的EST-SSR分子标记开发

Development of EST-SSR Molecular Markers Based on Transcriptome of Hemsleya

陈薇薇 幸宁
安徽农业科学2023,Vol.51Issue(9) :160-163.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.09.039

雪胆属转录组的EST-SSR分子标记开发

Development of EST-SSR Molecular Markers Based on Transcriptome of Hemsleya

陈薇薇 1幸宁1
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作者信息

  • 1. 安顺学院,贵州安顺 561000
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摘要

[目的]开发雪胆属表达序列标签简单重复序列(SSR)分子标记.[方法]对雪胆属肉花雪胆和母猪雪胆2个种进行转录组测序,检测SSR位点并设计引物,通过PCR扩增和毛细管电泳检验引物的有效性和多态性,并分析种间和种内遗传多样性.[结果]从200对引物中筛选出6对具有高多态性的引物,每对引物检测到的等位基因数5~8个,平均值6.3333个.有效等位基因(Ne)为2.4807~4.9828个,平均值3.7608个.多态信息含量(PIC)为0.5495~0.7583,平均值0.6729.遗传多样性分析显示,种间和种内居群均存在明显的遗传分化.[结论]该研究开发的EST-SSR引物具有丰富的多态性,为雪胆属植物的遗传多样性研究提供参考依据.

关键词

雪胆属/转录组/EST-SSR分子标记/遗传多样性

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基金项目

贵州省科技计划项目(黔科合LH字20177053号)

贵州省教育厅青年科技人才成长项目(黔教合KY字2018324号)

出版年

2023
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子:0.413
ISSN:0517-6611
参考文献量9
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