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雪胆属转录组的EST-SSR分子标记开发

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[目的]开发雪胆属表达序列标签简单重复序列(SSR)分子标记.[方法]对雪胆属肉花雪胆和母猪雪胆2个种进行转录组测序,检测SSR位点并设计引物,通过PCR扩增和毛细管电泳检验引物的有效性和多态性,并分析种间和种内遗传多样性.[结果]从200对引物中筛选出6对具有高多态性的引物,每对引物检测到的等位基因数5～8个,平均值6.3333个.有效等位基因(Ne)为2.4807～4.9828个,平均值3.7608个.多态信息含量(PIC)为0.5495～0.7583,平均值0.6729.遗传多样性分析显示,种间和种内居群均存在明显的遗传分化.[结论]该研究开发的EST-SSR引物具有丰富的多态性,为雪胆属植物的遗传多样性研究提供参考依据.
Development of EST-SSR Molecular Markers Based on Transcriptome of Hemsleya

陈薇薇、幸宁

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安顺学院,贵州安顺 561000

雪胆属 转录组 EST-SSR分子标记 遗传多样性

贵州省科技计划项目贵州省教育厅青年科技人才成长项目

黔科合LH字20177053号黔教合KY字2018324号

2023

10.3969/j.issn.0517-6611.2023.09.039

安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413
ISSN：0517-6611
年,卷(期)：2023.51(9)
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