安徽农业科学2023，Vol.51Issue(10) ：79-84,88.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.10.017

潜在马铃薯晚疫病抗性基因的表达和SNP标记分析

Expression and SNP Analysis of Candidate Solanum tuberosum Phytophthora infestans Resistance Genes

李晓川 王朝海 周平 马维 陈军 陆燚 吴显 王宗明 吴瑞 宋治豪 马杰 付毅
安徽农业科学2023，Vol.51Issue(10) ：79-84,88.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.10.017
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潜在马铃薯晚疫病抗性基因的表达和SNP标记分析

Expression and SNP Analysis of Candidate Solanum tuberosum Phytophthora infestans Resistance Genes

李晓川 1王朝海 1周平 1马维 1陈军 1陆燚 1吴显 1王宗明 1吴瑞 1宋治豪 1马杰 1付毅1
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作者信息

  • 1. 毕节市农业科学研究所,贵州毕节 551700
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摘要

从马铃薯参考基因组中筛选出了433个NBS-LRR类基因,并绘制这些基因在基因组中的分布图,这些基因的其中一部分成簇分布.马铃薯基因组测序协会(PGSC)的转录组数据分析显示,只有 12 个NBS-LRR类基因在PGSC的转录组数据中完全没有检测到表达,不同NBS-LRR类基因转录水平不同,一部分NBS-LRR类基因有较高的生物胁迫和激素刺激应激性.分析了这 433 个基因的编码区域的单核苷酸多态性(SNP)位点,SNP标记作为在高通量测序和生物大数据分析中最常使用的遗传标记,有助于鉴定NBS-LRR基因在不同马铃薯品种中的实际抗病性.

关键词

马铃薯/晚疫病/抗性基因

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基金项目

贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2020]1Y092)

贵州省科技计划项目(黔科合基础[2019]1002)

出版年

2023
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413
ISSN：0517-6611
参考文献量1
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