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蕨麻cpSSR序列特征分析

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基于NCBI数据库中收录的蕨麻叶绿体基因组序列,利用REPuter软件和MISA软件分析其微卫星分布规律.结果显示,在叶绿体基因组中共检测到34个散在重复序列,22个分布在LSC区,10个分布在IR区,2个分布在SSC区.使用MISA共注释到92个SSR位点,平均每1 820 bp出现1个SSR位点.SSR主要分布在LSC区(79.07%),重复序列主要以单碱基为主,占总数量的86.05%.微卫星长度平均为12 bp,大多数长度为10 bp,说明蕨麻中重复基元较短的微卫星变异速率较快.
Characterization Analysis of Microsatellite in Chloroplast of Potentilla anserina

田甜、李军乔、王鑫慈、曲俊儒

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青海民族大学生态环境与资源学院,青海西宁 810007

青藏高原蕨麻产业研究院,青海西宁 810007

蕨麻 叶绿体基因组 微卫星

青海省重点研发与转化计划青海民族大学2021年研究生创新项目

2022-NK-120954M2021005

2023

10.3969/j.issn.0517-6611.2023.12.021

安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413
ISSN：0517-6611
年,卷(期)：2023.51(12)
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