摘要
基于NCBI数据库中收录的蕨麻叶绿体基因组序列,利用REPuter软件和MISA软件分析其微卫星分布规律.结果显示,在叶绿体基因组中共检测到34个散在重复序列,22个分布在LSC区,10个分布在IR区,2个分布在SSC区.使用MISA共注释到92个SSR位点,平均每1 820 bp出现1个SSR位点.SSR主要分布在LSC区(79.07%),重复序列主要以单碱基为主,占总数量的86.05%.微卫星长度平均为12 bp,大多数长度为10 bp,说明蕨麻中重复基元较短的微卫星变异速率较快.
基金项目
青海省重点研发与转化计划(2022-NK-120)
青海民族大学2021年研究生创新项目(954M2021005)
国家科技期刊平台
NSTL
维普
万方数据