安徽农业科学2023,Vol.51Issue(14) :168-177.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.14.041

基于DIA LC-MS的高淀粉型与低淀粉型粉葛叶片的定量蛋白质组学差异

Quantitative Proteomics Differences of Leaves in Pueraria thomsonii with the High and Low Starch Content Based on DIA LC-MS

黄琦 程建峰 朱卫丰 褚怀亮 赵文峰 葛菲 吴波 丁立军 张建华 余聪
安徽农业科学2023,Vol.51Issue(14) :168-177.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.14.041

基于DIA LC-MS的高淀粉型与低淀粉型粉葛叶片的定量蛋白质组学差异

Quantitative Proteomics Differences of Leaves in Pueraria thomsonii with the High and Low Starch Content Based on DIA LC-MS

黄琦 1程建峰 2朱卫丰 3褚怀亮 1赵文峰 1葛菲 3吴波 3丁立军 1张建华 1余聪1
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作者信息

  • 1. 江西绿色生态葛研究所,江西横峰 334300
  • 2. 江西农业大学农学院,江西南昌 330045
  • 3. 江西中医药大学药学院,江西南昌 330004
  • 折叠

摘要

[目的]寻求粉葛生长发育的蛋白调控机制.[方法]以高淀粉型赣葛1 号(鲜葛根含淀粉20%,干葛根含淀粉35%)和低淀粉型赣葛2号(鲜葛根含淀粉14%,干葛根含淀粉25%)为材料,采用基于全扫描数据非依赖性采集高分辨率色谱-质谱(DIA LC-MS)的定量蛋白质组学技术得到差异蛋白质,并对差异蛋白进行GO富集、KEGG通路和KOG分析.[结果]2 个不同粉葛叶片中有 178 个蛋白(101个上调和77个下调)存在显著差异,主要涉及分子功能,但|log2(FC)|>5.0 的差异蛋白仅占11.2%.GO富集分析表明,差异蛋白主要富集在代谢过程、催化活性、水解酶活性、细胞部分、细胞内部分、细胞质部分和细胞内细胞器类别.KEEG富集代谢途径集中在苯丙氨酸生物合成、植物体内的MAPK信号通路、次生代谢物生物合成、丙酮酸代谢和脂肪酸代谢.KOG分析显示,差异蛋白功能主要归为核苷酸转运和代谢、核糖体结构和生物发生、能量产生和转换、信号转导以及翻译后蛋白修饰、周转和伴侣机制.差异程度极大的蛋白依次为上调的类LHCⅡ型1叶绿素a-b结合蛋白、kunitz家族胰蛋白酶和蛋白酶抑制剂前体、凝集素类蛋白和几丁质酶同源物及下调的类溶酶体Pro-X羧肽酶、预测的类dCTP焦磷酸酶1、富含半胱氨酸的受体类蛋白激酶25和色氨酸转氨酶相关蛋白4.[结论]研究结果为粉葛的生长发育、营养成分和活性物质的合成及调控、遗传改良及分子育种等提供数据支撑和技术途径.

关键词

粉葛/高淀粉型/低淀粉型/定量蛋白组学/差异蛋白/DIA/LC-MS

Key words

Pueraria thomsonii/High starch type/Low starch type/Quantitative proteomics/Differential proteins/DIA LC-MS

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基金项目

国家重点研发计划(2017YFC1702901)

江西省现代农业产业技术体系建设专项(JXARS-16)

出版年

2023
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子:0.413
ISSN:0517-6611
参考文献量12
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