基于DIA LC-MS的高淀粉型与低淀粉型粉葛叶片的定量蛋白质组学差异

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中文摘要：[目的]寻求粉葛生长发育的蛋白调控机制.[方法]以高淀粉型赣葛1 号(鲜葛根含淀粉20%,干葛根含淀粉35%)和低淀粉型赣葛2号(鲜葛根含淀粉14%,干葛根含淀粉25%)为材料,采用基于全扫描数据非依赖性采集高分辨率色谱-质谱(DIA LC-MS)的定量蛋白质组学技术得到差异蛋白质,并对差异蛋白进行GO富集、KEGG通路和KOG分析.[结果]2 个不同粉葛叶片中有 178 个蛋白(101个上调和77个下调)存在显著差异,主要涉及分子功能,但|log2(FC)|＞5.0 的差异蛋白仅占11.2%.GO富集分析表明,差异蛋白主要富集在代谢过程、催化活性、水解酶活性、细胞部分、细胞内部分、细胞质部分和细胞内细胞器类别.KEEG富集代谢途径集中在苯丙氨酸生物合成、植物体内的MAPK信号通路、次生代谢物生物合成、丙酮酸代谢和脂肪酸代谢.KOG分析显示,差异蛋白功能主要归为核苷酸转运和代谢、核糖体结构和生物发生、能量产生和转换、信号转导以及翻译后蛋白修饰、周转和伴侣机制.差异程度极大的蛋白依次为上调的类LHCⅡ型1叶绿素a-b结合蛋白、kunitz家族胰蛋白酶和蛋白酶抑制剂前体、凝集素类蛋白和几丁质酶同源物及下调的类溶酶体Pro-X羧肽酶、预测的类dCTP焦磷酸酶1、富含半胱氨酸的受体类蛋白激酶25和色氨酸转氨酶相关蛋白4.[结论]研究结果为粉葛的生长发育、营养成分和活性物质的合成及调控、遗传改良及分子育种等提供数据支撑和技术途径.

外文标题：Quantitative Proteomics Differences of Leaves in Pueraria thomsonii with the High and Low Starch Content Based on DIA LC-MS

外文关键词：

Pueraria thomsoniiHigh starch typeLow starch typeQuantitative proteomicsDifferential proteinsDIA LC-MS

作者：

黄琦、程建峰、朱卫丰、褚怀亮、赵文峰、葛菲、吴波、丁立军、张建华、余聪

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作者单位：

江西绿色生态葛研究所,江西横峰 334300

江西农业大学农学院,江西南昌 330045

江西中医药大学药学院,江西南昌 330004

关键词：

粉葛高淀粉型低淀粉型定量蛋白组学差异蛋白 DIA LC-MS

基金：

国家重点研发计划江西省现代农业产业技术体系建设专项

项目编号：

2017YFC1702901JXARS-16

出版年：

2023

DOI：

10.3969/j.issn.0517-6611.2023.14.041

安徽农业科学

安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413

ISSN：0517-6611

年,卷(期)：2023.51(14)

参考文献量12