安徽农业科学2023,Vol.51Issue(15) :88-92,118.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.15.021

艾草等10种精油植物单萜合成酶生物信息学分析

Bioinformatics Analysis of Monoterpene Synthase in Ten Essential Oil Plants Including Artemisia argyi

景炳年 魏磊 谢晓阳 刘雨晴 周雍 王伟
安徽农业科学2023,Vol.51Issue(15) :88-92,118.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.15.021

艾草等10种精油植物单萜合成酶生物信息学分析

Bioinformatics Analysis of Monoterpene Synthase in Ten Essential Oil Plants Including Artemisia argyi

景炳年 1魏磊 1谢晓阳 1刘雨晴 1周雍 1王伟1
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作者信息

  • 1. 河南省科学院河南省植物天然产物开发工程技术研究中心,河南郑州 450002
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摘要

[目的]分析比较10种富含精油植物mono-TPS核苷酸和氨基酸序列.[方法]通过生物信息学相关软件和网站比对和分析 10种mono-TPS基因及蛋白序列,对其结构、理化性质、磷酸化位点、亲/疏水性、跨膜结构域、亚细胞定位、二级结构、功能域、三级结构及进化关系进行预测和分析.[结果]10种精油植物mono-TPS氨基酸序列结构与理化性质基本一致,具有亲水性,多不稳定,不含跨膜结构域;可能定位在质膜、线粒体内膜、细胞核或线粒体基质中;二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主要构件,序列中包括底物结合区、镁离子结合位点和天冬氨酸富集区,具有典型的植物萜类环化酶活性结构域,是Isoprenoid-Biosyn-C1 超级家族成员之一,是一种类异戊二烯生物合成酶.通过进化树分析单萜合成酶,艾草与玉米进化程度相似.[结论]该研究结果可为精油植物单萜化合物的研究提供理论基础.

关键词

精油植物/单萜合成酶/生物信息学分析

Key words

Essential oil plants/Monoterpene synthase/Bioinformatics analysis

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基金项目

河南省科技攻关计划(222102110219)

河南省科学院重大科研项目聚焦专项(210113003)

出版年

2023
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子:0.413
ISSN:0517-6611
参考文献量14
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