安徽农业科学2023,Vol.51Issue(15) :93-96,103.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.15.022

鸡Myf5蛋白结构与功能的生物信息学分析

Bioinformatics Analysis of the Protein Structure and Function of Chicken Myf5

张珂 于欣淼 彭星瑞
安徽农业科学2023,Vol.51Issue(15) :93-96,103.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.15.022

鸡Myf5蛋白结构与功能的生物信息学分析

Bioinformatics Analysis of the Protein Structure and Function of Chicken Myf5

张珂 1于欣淼 1彭星瑞1
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作者信息

  • 1. 沈阳大学生命科学与工程学院,辽宁沈阳 110044
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摘要

[目的]分析并预测鸡Myf5蛋白的结构与生物学功能.[方法]采用ProtParam、ProtScale、SingnalP-4.1、STRING等软件对鸡Myf5蛋白的序列结构及互作蛋白进行分析.[结果]该蛋白由 258 个氨基酸构成,分子式为C1221H1915 N359O391S18,氨基酸残基中带负电荷的(Asp+Glu)共有34个,氨基酸残基中带正电荷的(Arg+Lys)共有29 个;理论等电点(pI)为 5.86,半衰期为 30 h,不稳定性指数为 97.59(>40);亲水性平均值(GRAVY)为-0.701,脂溶指数为 54.92;其二级结构主要以无规则卷曲为主,占比 63.57%,其次为α-螺旋,占比29.84%;该蛋白定位于细胞核中,不具备跨膜性,共有74个潜在的磷酸化位点,无信号肽,为亲水性不稳定蛋白.蛋白互作分析结果显示,鸡Myf5 关联的蛋白有PAX7、PAX3、SOX10、MYOD1、MYOG和SDC4,进化分析结果显示不同物种间该蛋白序列具有较高的保守性.[结论]该蛋白可能在鸡肌肉的生长发育过程中发挥重要作用,为进一步探索其功能奠定基础.

关键词

/成肌因子5/生物信息学分析

Key words

Chicken/Myf5/Bioinformatics analysis

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基金项目

辽宁省博士科研启动基金(2019-BS-171)

出版年

2023
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子:0.413
ISSN:0517-6611
参考文献量1
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