安徽农业科学2023，Vol.51Issue(16) ：86-89.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.16.021

基于COI基因分析叶尔羌河 5 种鲤科鱼类遗传多样性

Genetic Diversity of Five Cyprinidae Fishes in Yarkant River Based on COI Gene

张小雨 靳文慧 王佳 王玉涛
安徽农业科学2023，Vol.51Issue(16) ：86-89.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.16.021
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基于COI基因分析叶尔羌河 5 种鲤科鱼类遗传多样性

Genetic Diversity of Five Cyprinidae Fishes in Yarkant River Based on COI Gene

张小雨 1靳文慧 1王佳 1王玉涛1
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作者信息

  • 1. 喀什大学生命与地理科学学院/新疆帕米尔高原生物资源与生态重点实验室,新疆喀什 844000
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摘要

[目的]探讨线粒体COI基因对叶尔羌河鱼类资源鉴定及遗传多样性分析的适应性.[方法]分析叶尔羌河5种鲤科的50 条COI基因片段序列,并结合GenBank比对筛选出的12条高同源序列基于邻接法构建系统进化树.[结果]5 种鱼类COI基因同源序列的长度675 bp,碱基组成展现出显著A/T的偏倚性,转换/颠换的比值(R值)为3.2;核苷酸变异位点有146个,定义了10个单倍型;除塔里木裂腹鱼和宽口裂腹鱼物种间的遗传距离(0.002 4),其余物种间的遗传距离均符合2%阈值或10倍原则;系统进化树中,除塔里木裂腹鱼和宽口裂腹鱼外,斑重唇鱼、鲫鱼和鲤鱼均形成独立分支,推测两者亲缘关系较近或物种间未达到分化程度.[结论]COI基因适用于叶尔羌河除裂腹鱼属外鱼类的物种鉴定及多样性分析.

关键词

COI基因/鲤科鱼类/遗传多样性/叶尔羌河

Key words

COI gene/Cyprinid fish/Genetic diversity/Yarkant River

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基金项目

新疆帕米尔高原生物资源与生态重点实验室开放课题(XJDX114-2021-10)

出版年

2023
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413
ISSN：0517-6611
参考文献量20
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