安徽农业科学2023，Vol.51Issue(16) ：90-94.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.16.022

锦鲤疱疹病毒胸苷激酶基因的生物信息学分析

Bioinformatics Analysis of Koi Herpesvirus Thymidine Kinase Gene

陈莉 周广彪 郑耿东 温尔英 陈文婉 吴松浩 利光辉
安徽农业科学2023，Vol.51Issue(16) ：90-94.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.16.022
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锦鲤疱疹病毒胸苷激酶基因的生物信息学分析

Bioinformatics Analysis of Koi Herpesvirus Thymidine Kinase Gene

陈莉 1周广彪 1郑耿东 1温尔英 1陈文婉 1吴松浩 2利光辉1
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作者信息

  • 1. 汕头海关技术中心,广东汕头515041;汕头海关技术中心/汕头大学理学院水产品联合实验室,广东汕头 515041
  • 2. 汕头海关动植处,广东汕头 515057
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摘要

[目的]探究锦鲤疱疹病毒胸苷激酶(Thymidine Kinase,TK)基因编码蛋白的生物学特性及结构功能特征.[方法]采用生物信息学软件对胸苷激酶蛋白的理化性质、亲/疏水性、结构域及二级结构和三级结构进行预测分析.[结果]TK蛋白编码224 个氨基酸,不稳定系数较大,属于不稳定蛋白;且该蛋白不含有信号肽及跨膜结构,位于膜外;结构域位于2-175氨基酸残基区域,与其他病毒氨基酸序列比对分析,锦鲤疱疹病毒TK基因与鲤科疱疹病毒亲缘关系较近.[结论]对锦鲤疱疹病毒TK基因的分析,为深入研究锦鲤疱疹病毒的特性及分子机制,采取更有效的精准防控措施提供了基础保障,也为下一步的研究计划提供了方向.

关键词

锦鲤疱疹病毒/胸苷激酶/生物信息学

Key words

Koi herpesvirus/Thymidine kinase/Bioinformatics

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基金项目

汕头海关科研项目(2020STK009)

汕头海关科研项目(2022STK004)

汕头海关科研项目(2022STK005)

出版年

2023
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413
ISSN：0517-6611
参考文献量9
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