安徽农业科学2023，Vol.51Issue(18) ：107-114.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.18.024

鮰爱德华菌密度感应系统LuxI/LuxR的克隆及生物信息学分析

Molecular Cloning and Bioinformatics Analysis of Quorum Sensing System LuxI/LuxR of Edwardsiella ictaluri

郭锦志 马士杰 韩先干 付立霞
安徽农业科学2023，Vol.51Issue(18) ：107-114.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.18.024
✕
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 维普
  • 万方数据

鮰爱德华菌密度感应系统LuxI/LuxR的克隆及生物信息学分析

Molecular Cloning and Bioinformatics Analysis of Quorum Sensing System LuxI/LuxR of Edwardsiella ictaluri

郭锦志 1马士杰 1韩先干 2付立霞1
扫码查看

作者信息

  • 1. 扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州225009
  • 2. 中国农业科学院上海兽医研究所,上海200241
  • 折叠

摘要

克隆鮰爱德华菌(Edwardsiella ictaluri)YCH株酰基高丝氨酸内酯(Acyl homoserine lactones,AHLs)合成酶(LuxI)和AHLs受体蛋白(LuxR)的全长基因,并对其进行生物信息学分析.序列分析结果显示,LuxI全长666 bp,共编码221个氨基酸;LuxR全长720 bp,编码239个氨基酸.构建LuxI/LuxR的系统发生树,结果显示,鮰爱德华菌LuxI/LuxR与迟缓爱德华菌(Edwardsiella tarda)、杀鱼爱德华菌(Edwardsiella piscicida)、保科爱德华菌(Edwardsiella hoshinae)等有较近亲缘关系.利用SWISS-Model软件,分别以1K4J.1.A(46.15％)和5l09.1.A(40.83％)蛋白作为模板对LuxI蛋白的8-189区域和LuxR蛋白2个功能结构域Pfam:Autoind_bind(9～151氨基酸)和HTH_LUXR(171～228氨基酸)进行分子模拟,其中LuxI结构域内有明显的"V"形疏水腔结构,LuxR的N-端结构域有α-β-α排列,C-端结构域内有螺旋—转角—螺旋结构.

关键词

鮰爱德华菌/密度感应系统/LuxI/LuxR/基因克隆/生物信息学

Key words

Edwardsiella ictaluri/Quorum sensing system/LuxI/LuxR/Gene cloning/Bioinformatics

引用本文复制引用

基金项目

农业农村部渔用药物创制重点实验室和广东省水产动物免疫技术重点实验室项目(201801)

出版年

2023
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413
ISSN：0517-6611
参考文献量27
段落导航相关论文