安徽农业科学2023，Vol.51Issue(19) ：31-35,57.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.19.007

广东烟区育种材料遗传性状及群体结构分析

Analysis of Population Diversity and Structure of Main Cultivars in Guangdong Province Based on Whole Genome Resequencing Data

宗钊辉 陈帧禄 贺广生 王军 曾涛 陈泽鹏 赵伟才
安徽农业科学2023，Vol.51Issue(19) ：31-35,57.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.19.007
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广东烟区育种材料遗传性状及群体结构分析

Analysis of Population Diversity and Structure of Main Cultivars in Guangdong Province Based on Whole Genome Resequencing Data

宗钊辉 1陈帧禄 2贺广生 2王军 1曾涛 1陈泽鹏 3赵伟才1
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作者信息

  • 1. 广东省烟草科学研究所,广东韶关512000;广东烟草韶关市有限公司,广东韶关 512000
  • 2. 中国烟草总公司广东省公司,广东广州 510000
  • 3. 广东烟草韶关市有限公司,广东韶关 512000
  • 折叠

摘要

为明确广东烟草主要育种材料间的遗传关系,通过对广东烟草的5个主要育种材料(YY98、HY1、NX002、NX212与K326)重测序,进行遗传多样性及群体结构分析.平均测序深度高达25.10X,R_q30>95％,基因组平均覆盖度为92.88％,通过筛选分析,最终获得26728180 SNPs,不同染色体间SNP数量分布差异较大,SNP密度在7.4～11.1个/kb,其中17号染色体上数量最多.不同品种间在Chr3、Chr4、Chr8、Chr12、Chr14和Chr22上分化程度较大,其中Chr3染色体分化程度最大,平均杂合度为0.4715.K326、NX002、NX212群体的杂合度大于0.5000,具备较高的遗传多样性.系统发育树与主成分分析均认为NX002与K326,HY1与YY98亲缘关系接近,聚为一类,NX212单独分支.该研究为广东烟草亲本选配、优良育种材料利用提供技术支持.

关键词

烟草品种/重测序/SNP/群体分析/多样性分析

Key words

Tobacco varieties/Resequencing/SNP/Population analysis/Diversity analysis

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基金项目

广东省烟草专卖局科技项目(粤烟科中长期项201801)

广东省烟草专卖局科技项目(粤烟科202108)

出版年

2023
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413
ISSN：0517-6611
参考文献量24
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