安徽农业科学2023,Vol.51Issue(19) :95-99.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.19.020

不同悬钩子属植物ITS序列的多态性分析

Polymorphism Analysis of ITS Sequences in Different Rubus Genera

高柱 郭芙蓉 杨静远 汪琪
安徽农业科学2023,Vol.51Issue(19) :95-99.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.19.020

不同悬钩子属植物ITS序列的多态性分析

Polymorphism Analysis of ITS Sequences in Different Rubus Genera

高柱 1郭芙蓉 2杨静远 2汪琪2
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作者信息

  • 1. 安徽国科检测科技有限公司,安徽合肥 230041
  • 2. 安徽农业大学生命科学学院,安徽合肥 230036
  • 折叠

摘要

以13份悬钩子属植物DNA为模板,用PCR技术克隆获得其ITS序列.测序结果分析表明,ITS序列总长在462~464 bp,其中5.8S、ITS1和ITS2序列长度分别为164、208~210、254~255 bp.序列差异比对分析表明,5.8S序列相对保守,不同悬钩子属植物仅有1个碱基差异;ITS2序列变异较大,GC含量在53.73%~55.12%,存在32个变异位点,其中单核苷酸差异位点14个.基于ITS2序列的系统进化树分析表明,13份悬钩子种质资源可分为4簇,其中簇Ⅰ包含掌叶覆盆子种质资源A9、A29和甜叶覆盆子种质资源GH14,簇Ⅱ为HH2、W5和JF9等山莓种质资源,簇Ⅲ为红树莓及黑莓种质资源,簇Ⅳ为TW1、GA1、S和GB3等插田泡种质资源.ITS2序列聚类分析的结果与形态特征分类的结果是一致的,表明外缘标准的ITS2序列对悬钩子属植物资源进行物种分类和鉴定是可靠的.

关键词

悬钩子属/ITS序列/克隆/分子鉴定

Key words

Rubus/ITS sequence/Cloning/Molecular identification

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基金项目

安徽省科技重大专项(202103a07020003)

安徽省重点研究与开发-标准化专项项目(202104h04020036)

安徽省重点研究与开发-面上攻关项目(202104a07020013)

安徽省重点研究与开发-生态环境专项项目(202104i07020006)

出版年

2023
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子:0.413
ISSN:0517-6611
参考文献量9
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