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拮抗水稻病原菌假单胞菌AH菌株的鉴定及全基因组序列分析

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[目的]探究菌株AH的生防潜力和基因组序列信息,以解析其防病机制,挖掘次级代谢产物基因资源.[方法]采用稀释涂布平板法分离水稻的叶际微生物,筛选具有拮抗效果的菌株;根据形态学、16S rDNA和gyrB基因测序和系统发育分析,鉴定其种属;利用平板抑菌试验明确其抑菌谱;大田喷施菌悬液明确其防治效果.继而,利用第二代Illumina与第三代PacBio结合的测序方法对生防菌进行全基因组测序,对测序数据进行基因组组装、基因预测与功能注释、次级代谢产物合成基因簇预测等分析.[结果]AH是一株短杆状恶臭假单胞菌株,对稻瘟病菌、茎点霉菌、水稻纹枯病菌和水稻黄单胞菌具有广谱抗菌活性,且田间施用AH菌液可显著降低水稻白叶枯病和稻瘟病的病害等级.抗生素敏感性测试揭示菌株AH对氨基糖苷类抗生素高度敏感.AH基因组全长为5 889 125 bp,编码5 215个基因,GC含量为63.74%,有19个rRNA、77个tRNA和78个nRNA,antiSMASH预测得到8 个次级代谢产物合成基因簇.[结论]AH菌株具有良好生防潜力,深层机制解析可为病害防控提供科学依据.
Identification and Whole Genome Analysis of Pseudomonas putida AH Strain Antagonistic to Rice Pathogens

Pseudomonas putida AHBiocontrolRice blastRice bacterial blight

胡逸群、沈文杰、陈晴晴、张爱芳

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安徽省农业科学院植物保护与农产品质量安全研究所,安徽合肥 230001

恶臭假单胞AH 生物防治 稻瘟病 水稻白叶枯病

国家自然科学基金安徽省自然科学基金

322022732108085QC117

2023

10.3969/j.issn.0517-6611.2023.20.034

安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413
ISSN：0517-6611
年,卷(期)：2023.51(20)
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