摘要
[目的]探究菌株AH的生防潜力和基因组序列信息,以解析其防病机制,挖掘次级代谢产物基因资源.[方法]采用稀释涂布平板法分离水稻的叶际微生物,筛选具有拮抗效果的菌株;根据形态学、16S rDNA和gyrB基因测序和系统发育分析,鉴定其种属;利用平板抑菌试验明确其抑菌谱;大田喷施菌悬液明确其防治效果.继而,利用第二代Illumina与第三代PacBio结合的测序方法对生防菌进行全基因组测序,对测序数据进行基因组组装、基因预测与功能注释、次级代谢产物合成基因簇预测等分析.[结果]AH是一株短杆状恶臭假单胞菌株,对稻瘟病菌、茎点霉菌、水稻纹枯病菌和水稻黄单胞菌具有广谱抗菌活性,且田间施用AH菌液可显著降低水稻白叶枯病和稻瘟病的病害等级.抗生素敏感性测试揭示菌株AH对氨基糖苷类抗生素高度敏感.AH基因组全长为5 889 125 bp,编码5 215个基因,GC含量为63.74%,有19个rRNA、77个tRNA和78个nRNA,antiSMASH预测得到8 个次级代谢产物合成基因簇.[结论]AH菌株具有良好生防潜力,深层机制解析可为病害防控提供科学依据.
国家科技期刊平台
NSTL
维普
万方数据