安徽农业科学2023，Vol.51Issue(21) ：105-108,121.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.21.024

基于线粒体Ctyb基因的滆湖3种黄颡鱼遗传多样性分析

Genetic Diversity of Three Species of Pelteobagrus in Ge Lake Based on Cytb Gene Sequence

李大命 刘洋 刘燕山 唐晟凯 谷先坤 殷稼雯
安徽农业科学2023，Vol.51Issue(21) ：105-108,121.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.21.024
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基于线粒体Ctyb基因的滆湖3种黄颡鱼遗传多样性分析

Genetic Diversity of Three Species of Pelteobagrus in Ge Lake Based on Cytb Gene Sequence

李大命 1刘洋 2刘燕山 1唐晟凯 1谷先坤 1殷稼雯1
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作者信息

  • 1. 江苏省淡水水产研究所/江苏省内陆水域渔业资源重点实验室,江苏南京 210017
  • 2. 江苏省淡水水产研究所/江苏省内陆水域渔业资源重点实验室,江苏南京 210017;南京师范大学海洋科学与工程学院,江苏南京 210046
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摘要

为掌握滆湖3种黄颡鱼野生资源的种质遗传状况,采用线粒体Ctyb基因探索黄颡鱼、光泽黄颡鱼和长须黄颡鱼的遗传多样性和进化历史动态.通过PCR扩增、测序和序列分析,获得3种黄颡鱼的Ctyb基因全序列,长度均为1138 bp.3种黄颡鱼Cytb基因的碱基组成具有偏倚性,碱基A+T的含量(55.6％)高于G+C的含量(44.4％).49尾黄颡鱼的Cytb基因序列有23个多态位点,定义17种单倍型,单倍型多样性为0.903,核苷酸多样性为0.00240;40尾光泽黄颡鱼的Cytb基因序列有25个多态位点,定义17种单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.936和0.00459;32尾长须黄颡鱼的Cytb基因序列有20个多态位点,定义11种单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.829和0.00225.整体来看,3种黄颡鱼的单倍型多样性较为丰富,但核苷酸多样性较低.黄颡鱼、光泽黄颡鱼和长须黄颡鱼的种内遗传距离分别为0～0.006、0～0.012和0～0.008.3种黄颡鱼的种间遗传距离为0.078～0.138,长须黄颡鱼与黄颡鱼的亲缘关系较近、与光泽黄颡鱼的亲缘关系较远.Tajima's D和Fu's Fs中性检验值均为负值,且核苷酸不配对分布图呈现单峰型,表明3种黄颡鱼经历过明显的种群扩张过程.该研究结果可为滆湖3种黄颡鱼的种质资源保护及开发利用提供参考依据.

关键词

遗传多样性/Cytb基因/黄颡鱼/光泽黄颡鱼/长须黄颡鱼

Key words

Genetic diversity/Cytb gene/Pelteobagrus fulvidraco/Pelteobagrus nitidus/Pelteobagrus eupogon

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基金项目

江苏省水生生物资源重大专项暨水生野生动物资源普查项目(第一次)(ZYHB16-3)

淡水渔业资源监测项目(2019)(2019-SJ-018-2)

渔业生态监测项目(2020)(2020-SJ-016-2)

出版年

2023
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413
ISSN：0517-6611
参考文献量17
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