安徽农业科学2023，Vol.51Issue(23) ：85-89.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.23.020

陆地棉转录因子WRKY29的鉴定及表达分析

Identification and Expression Analysis of Transcription Factor WRKY29 in Gossypium hirsutum L.

刘文豪 余渝 王旭文 田琴 吴珂 马麒 赵福相 孔宪辉
安徽农业科学2023，Vol.51Issue(23) ：85-89.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.23.020
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陆地棉转录因子WRKY29的鉴定及表达分析

Identification and Expression Analysis of Transcription Factor WRKY29 in Gossypium hirsutum L.

刘文豪 1余渝 1王旭文 1田琴 1吴珂 1马麒 1赵福相 1孔宪辉1
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作者信息

  • 1. 新疆农垦科学院棉花研究所/农业农村部西北内陆区棉花生物学与遗传育种重点实验室/棉花生物学国家重点实验室,新疆石河子 832000
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摘要

[目的]揭示WRKY29基因表达机理,为分子辅助育种创新种质提供基因资源.[方法]以WRKY家族成员中的WRKY29为目标,通过生物信息学方法分析陆地棉WRKY29转录因子的理化性质、系统进化关系、亚细胞定位建模和染色体分布定位、基因的组织特异性表达.[结果]生物信息学分析表明,陆地棉WRKY29转录因子含有279个氨基酸残基,理论等电点为6.08,具有典型的WRKY保守结构域,属于不稳定蛋白.蛋白质二级结构以α螺旋和无规卷曲为主.系统进化关系分析得知WRKY29与同为锦葵目的物种聚类在同一进化分支,亚细胞定位预测WRKY29转录因子分布在细胞核,而染色体定位发现WRKY29转录因子分布在A02染色体40～48 Mb区域内.WRKY29转录因子具有正调控功能,组织表达模式发现在根部具有显著性表达.[结论]陆地棉转录因子WRKY29的鉴定及表达分析为棉花生长发育过程中的抗逆研究提供了重要线索.

关键词

WRKY29/转录因子/生物信息学/育种

Key words

WRKY29/Transcription factor/Bioinformatics/Breeding

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基金项目

国家重点研发计划项目(2017YFD0101601)

兵团重点领域创新团队建设计划项目(2017CB011)

棉花生物学国家重点实验室开放课题(CB2022A27)

出版年

2023
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413
ISSN：0517-6611
参考文献量7
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