安徽农业科学2024，Vol.52Issue(5) ：91-95.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2024.05.022

基于全基因组重测序分析中国地方鸡的群体结构和保护优先权

Population Structure and Conservation Priorities Analysis of Chinese Indigenous Chicken Using Whole-genome Re-sequencing

高超群 蔡钊 胡晓玉 魏梦雅 王克君 赵姝灿 李文婷 康相涛
安徽农业科学2024，Vol.52Issue(5) ：91-95.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2024.05.022
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基于全基因组重测序分析中国地方鸡的群体结构和保护优先权

Population Structure and Conservation Priorities Analysis of Chinese Indigenous Chicken Using Whole-genome Re-sequencing

高超群 1蔡钊 2胡晓玉 1魏梦雅 2王克君 2赵姝灿 2李文婷 1康相涛1
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作者信息

  • 1. 河南农业大学动物科技学院,河南郑州450046;神农种业实验室,河南郑州450046
  • 2. 河南农业大学动物科技学院,河南郑州450046
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摘要

[目的]旨在对中国本土鸡品种群体结构和保护优先权进行分析,促进畜牧业的可持续健康发展.[方法]收集了8个品种、共96个个体的重测序数据.通过主成分PCA分析、构建系统进化树及近交和遗传距离分析来了解群体结构,计算去除每个品种后总体基因和等位基因多样性的增减、模拟计算品种对具有最大基因多样性和最大等位基因多样性合成群体的贡献占比,进而系统评估品种保护优先权.[结果]所研究的品种可分为4个集群,其中藏鸡与其他品种分化最高,其自身分为2个亚群,其他品种则分为南北2个集群.藏鸡对遗传多样性的贡献最大;其次是文昌鸡和瑶鸡,此三者应考虑作为优先保护的品种.[结论]该研究结果将可为地方鸡品种保护与开发利用提供参考.

关键词

全基因组重测序/群体结构/遗传多样性/保护优先权

Key words

Whole-genome re-sequencing/Population structure/Genetic diversity/Conservation priority

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基金项目

中国博士后科学基金第66批面上资助二等资助(2019M66-2497)

河南省博士后科研二等资助项目(201902030)

出版年

2024
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413
ISSN：0517-6611
参考文献量26
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