基于全基因组重测序分析中国地方鸡的群体结构和保护优先权

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万方数据
维普

中文摘要：[目的]旨在对中国本土鸡品种群体结构和保护优先权进行分析,促进畜牧业的可持续健康发展.[方法]收集了8个品种、共96个个体的重测序数据.通过主成分PCA分析、构建系统进化树及近交和遗传距离分析来了解群体结构,计算去除每个品种后总体基因和等位基因多样性的增减、模拟计算品种对具有最大基因多样性和最大等位基因多样性合成群体的贡献占比,进而系统评估品种保护优先权.[结果]所研究的品种可分为4个集群,其中藏鸡与其他品种分化最高,其自身分为2个亚群,其他品种则分为南北2个集群.藏鸡对遗传多样性的贡献最大;其次是文昌鸡和瑶鸡,此三者应考虑作为优先保护的品种.[结论]该研究结果将可为地方鸡品种保护与开发利用提供参考.

外文标题：Population Structure and Conservation Priorities Analysis of Chinese Indigenous Chicken Using Whole-genome Re-sequencing

外文关键词：

Whole-genome re-sequencingPopulation structureGenetic diversityConservation priority

作者：

高超群、蔡钊、胡晓玉、魏梦雅、王克君、赵姝灿、李文婷、康相涛

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作者单位：

河南农业大学动物科技学院,河南郑州450046

神农种业实验室,河南郑州450046

关键词：

全基因组重测序群体结构遗传多样性保护优先权

基金：

中国博士后科学基金第66批面上资助二等资助河南省博士后科研二等资助项目

项目编号：

2019M66-2497201902030

出版年：

2024

DOI：

10.3969/j.issn.0517-6611.2024.05.022

安徽农业科学

安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413

ISSN：0517-6611

年,卷(期)：2024.52(5)

参考文献量26