安徽农业科学2024,Vol.52Issue(5) :108-111,120.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2024.05.026

三角鲤线粒体基因组全序列测定及分析

Sequencing and Analysis of Complete Mitogenome of Cyprinus multitaeniata

李强 李文俊 韩崇 鲁同富 龚剑 桂林
安徽农业科学2024,Vol.52Issue(5) :108-111,120.DOI:10.3969/j.issn.0517-6611.2024.05.026

三角鲤线粒体基因组全序列测定及分析

Sequencing and Analysis of Complete Mitogenome of Cyprinus multitaeniata

李强 1李文俊 1韩崇 1鲁同富 2龚剑 2桂林1
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作者信息

  • 1. 广州大学生命科学学院,广东广州510006
  • 2. 广州大学环境科学与工程学院,广东广州510006
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摘要

[目的]三角鲤(Cyprinus multitaeniata)是我国具有重要经济价值的鱼类之一,了解三角鲤线粒体基因的结构和特点,为三角鲤的种群遗传多样性研究提供基础资料.[方法]采用26对引物扩增三角鲤的线粒体全基因,通过生物软件识别和分析各基因和非编码序列的位置和特点,并通过与GeneBank数据库已发表鲤科鱼类序列进行比较和构建系统发育树进行分析.[结果]三角鲤线粒体全基因总长度为16573 bp,碱基含量A为32.2%、T为24.9%、C为27.3%、G为15.6%;包括37个编码基因(编码蛋白基因13个、tRNA基因22个和rRNA基因2个)和2个非编码序列区(OL区和控制区).13个蛋白编码基因中,COX1的起始密码子为GTG,其他均为ATG;终止密码子包括TAG(ATP8)、TA(COX3、ATP6)、T(ND2、COX2、ND3、ND4、Cty b)和TAA(ND1、COX1、ND4L、ND5、ND6)3种.22个tRNA基因中,除了tRNASer(AGC)外其余都能折叠成典型的三叶草结构;三角鲤控制区序列可以识别出3个典型保守区域;系统发育分析表明,三角鲤与大眼鲤(C.megalophthalmus)亲缘关系较近.[结论]三角鲤线粒体基因组成、长度和排列顺序与典型的脊椎动物相同,在亲缘关系上与大眼鲤最近;线粒体基因组序列适用于三角鲤的系统发育分析.

关键词

三角鲤/线粒体基因组/全序列分析/系统发育

Key words

Cyprinus multitaeniata/Mitochondrial genome/Complete sequence analysis/Phylogeny

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基金项目

广州市科技计划项目(201804010486)

广东省教育科学规划课题(2021GXJK097)

出版年

2024
安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子:0.413
ISSN:0517-6611
参考文献量19
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