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三角鲤线粒体基因组全序列测定及分析

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[目的]三角鲤(Cyprinus multitaeniata)是我国具有重要经济价值的鱼类之一,了解三角鲤线粒体基因的结构和特点,为三角鲤的种群遗传多样性研究提供基础资料.[方法]采用26对引物扩增三角鲤的线粒体全基因,通过生物软件识别和分析各基因和非编码序列的位置和特点,并通过与GeneBank数据库已发表鲤科鱼类序列进行比较和构建系统发育树进行分析.[结果]三角鲤线粒体全基因总长度为16573 bp,碱基含量A为32.2％、T为24.9％、C为27.3％、G为15.6％;包括37个编码基因(编码蛋白基因13个、tRNA基因22个和rRNA基因2个)和2个非编码序列区(OL区和控制区).13个蛋白编码基因中,COX1的起始密码子为GTG,其他均为ATG;终止密码子包括TAG(ATP8)、TA(COX3、ATP6)、T(ND2、COX2、ND3、ND4、Cty b)和TAA(ND1、COX1、ND4L、ND5、ND6)3种.22个tRNA基因中,除了tRNASer(AGC)外其余都能折叠成典型的三叶草结构;三角鲤控制区序列可以识别出3个典型保守区域;系统发育分析表明,三角鲤与大眼鲤(C.megalophthalmus)亲缘关系较近.[结论]三角鲤线粒体基因组成、长度和排列顺序与典型的脊椎动物相同,在亲缘关系上与大眼鲤最近;线粒体基因组序列适用于三角鲤的系统发育分析.
Sequencing and Analysis of Complete Mitogenome of Cyprinus multitaeniata

Cyprinus multitaeniataMitochondrial genomeComplete sequence analysisPhylogeny

李强、李文俊、韩崇、鲁同富、龚剑、桂林

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广州大学生命科学学院,广东广州510006

广州大学环境科学与工程学院,广东广州510006

三角鲤 线粒体基因组 全序列分析 系统发育

广州市科技计划项目广东省教育科学规划课题

2018040104862021GXJK097

2024

10.3969/j.issn.0517-6611.2024.05.026

安徽农业科学
安徽省农业科学院

安徽农业科学

影响因子：0.413
ISSN：0517-6611
年,卷(期)：2024.52(5)
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