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番茄ERFb.2转录因子的克隆、生物信息学及表达特征分析

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通过克隆番茄SlERFb.2基因,并运用生物信息学对该基因的编码产物进行一级、二级、三级结构分析,并通过qRT-PCR技术检测SlERFb.2基因在不同处理不同时期的表达量,以期为番茄对非生物胁迫的响应机制提供参考依据.结果 表明:SlERFb.2基因含有开放阅读框5个,共编码258个氨基酸,属于酸性蛋白;其二级结构以α-螺旋为主,预测蛋白定位于细胞核上;且含有39个磷酸化位点与15个糖基化位点;启动子区主要以I-box为主,且含有多个诱导基因表达的顺势作用元件;三级结构相对简单,且该转录因子在番茄中存在4个互作蛋白,系统发育树得番茄与马铃薯的亲缘关系最近;qRT-PCR显示该基因对低温的响应特别敏感.
Cloning,Bioinformatics and Expression Analysis of ERFb.2 Transcription Factor in Tomato

金宝霞、魏小红、朱晓林、王伟杰

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甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃兰州730070

甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室,甘肃兰州730070

甘肃省干旱生境作物学重点实验室,甘肃兰州730070

甘肃农业大学农学院,甘肃兰州730070

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番茄 EFRb.2 生物信息学 表达分析

国家自然科学基金甘肃省教育厅优秀研究生"创新之星"资助项目

320604012021CXZX-001

2021

10.11937/bfyy.20212435

北方园艺
黑龙江省农业科学院 黑龙江省园艺学会 黑龙江省农业科学院编辑出版中心

北方园艺

北大核心
影响因子：0.506
ISSN：1001-0009
年,卷(期)：2021.(23)
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