首页|蒙古扁桃叶绿体遗传特征分析

蒙古扁桃叶绿体遗传特征分析

扫码查看
原文链接
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
以古老孑遗植物蒙古扁桃为试材,基于Illumina HiSeq XTen平台测序,采用生物信息学分析方法,研究了蒙古扁桃叶绿体基因组特征和系统发育情况,以期为蒙古扁桃和近缘种物种鉴定、系统发育地位以及早春观赏植物和西北荒漠草地植物的育种培育提供参考依据.结果表明:蒙古扁桃叶绿体基因组为四分体式结构.其蛋白编码基因共编码26428个密码子,有29种是偏好密码子.密码子UUU数目最多,达1034个;密码子GCG数目最少,为137个.编码亮氨酸的密码子数目最多(2637个),占总量的9.98％;编码色氨酸的密码子数目最少(531个)仅占到1.94％.根据设置参数,发现蒙古扁桃叶绿体基因组中串联重复有16个,SSR位点有31个.SSR大多位于基因间区IGS和LSC区域.SSR中未检测到三核苷酸重复.基于叶绿体全基因组序列数据发现蒙古扁桃与桃亚属的桃和甘肃桃亲缘关系较近.
Analysis of Chloroplast Genetic Characteristics of Amygdalus mongolica

Amygdalus mongolicachloroplastcodonrepeated sequencephylogeny

段春燕、王晓凌

展开 >

河南科技大学 农学院,河南 洛阳 471000

蒙古扁桃 叶绿体 密码子 重复序列 系统发育

国家自然科学基金资助项目河南省特色骨干学科建设-旱地绿色智慧农业学科群资助项目河南科技大学博士科研启动基金资助项目

U1304326171000014024-13480114

2024

10.11937/bfyy.20233115

北方园艺
黑龙江省农业科学院 黑龙江省园艺学会 黑龙江省农业科学院编辑出版中心

北方园艺

CSTPCD北大核心
影响因子：0.506
ISSN：1001-0009
年,卷(期)：2024.(2)
  • 9