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辣椒果实发育相关基因的电子克隆及生物信息学分析

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以cDNA-AFLP分析辣椒果实发育获得的长度为193 bp的TDF9-68-11为研究对象,采用电子克隆、PCR验证和生物信息学分析等方法,研究了辣椒果实发育相关基因的电子克隆及生物信息学功能分析,以期为辣椒果实发育相关基因的研究提供参考依据.结果表明:经过电子克隆最终获得长为1167 bp的拼接序列,设计引物PCR扩增和测序获得全长714 bp的序列,与拼接序列高度一致;该序列编码分子量为17.96 kD氨基酸链,其等电点为7.76偏中性;氨基酸链具有跨膜特性,可能存在5个磷酸化位点,该氨基酸链二级结构含有的α螺旋占42.3％、延伸链占19.6％、β转角占12.2％,以及26.4％的随机卷曲结构.氨基酸序列比对可以初步推断该氨基酸序列的功能与果实发育中醇脱氢相关生化反应有关.
In Silico Cloning and Bioinformatics Analysis of Genes Related to Pepper Fruit Development

pepperfruit developmentTDFin silico cloning

徐明磊、田辉、陈双臣

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河南质量工程职业学院,河南 平顶山 467001

河南科技大学 林学院,河南 洛阳 471003

辣椒 果实发育 TDF 电子克隆

国家自然科学基金资助项目河南省高等学校重点科研资助项目

3147186723B210008

2024

10.11937/bfyy.20233517

北方园艺
黑龙江省农业科学院 黑龙江省园艺学会 黑龙江省农业科学院编辑出版中心

北方园艺

CSTPCD北大核心
影响因子：0.506
ISSN：1001-0009
年,卷(期)：2024.(3)
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