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杨树HSF家族基因生物信息学与胁迫应答表达分析

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[目的]探究小黑杨热激转录因子HSF在应答高温和高盐胁迫时发挥的关键作用.保守结构域和顺式作用元件预测等对杨树HSF转录因子家族基因进行生物信息学分析.本研究以小黑杨为材料,经过37℃高温胁迫半个月后观察其形态变化;将小黑杨在37℃下分别处理0、12、24、48 h,采用RT-qPCR对小黑杨组织中的PsnHSFs基因进行时空表达分析;将小黑杨于150 mmol/L NaCl胁迫分别处理0、24 h,通过RNA-seq分析PsnHSFs基因的相对表达量变化,并通过RT-qPCR进行验证.[结果]通过结构特征和系统发育比较将29个HSF转录因子家族基因分成A、B和C三个亚家族,各亚家族分别包含18、10和1个HSF基因;HSF编码的氨基酸序列长度介于209～595之间,均为亲水性蛋白;其N端具有高度保守的DBD结构域,由三个保守基序构成;HSF基因启动子序列中包含DRE core、ABRE和TC-rich等多种顺式作用元件.小黑杨经37℃高温处理后其株高仅为对照的76.51％,叶片呈卷曲状,叶表面粗糙,叶面积显著减小且苗干多侧枝柔软无韧性.RT-qPCR与RNA-seq结果表明,PsnHSFs被高温、高盐胁迫诱导表达.高温处理后其株高仅为对照的76.51％,叶片呈卷曲状,叶表面粗糙,叶面积显著减小且苗干多侧枝柔软无韧性.RT-qPCR与RNA-seq结果表明,PsnHSFs被高温、高盐胁迫诱导表达.家族基因以及揭示HSF参与木本植物胁迫应答的分子机制调控具有参考意义.
Bioinformatics and stress response expression analysis of poplar HSF family genes

王雪怡、顾咏梅、张雪梅、姜廷波、刘焕臻

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东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室,黑龙江哈尔滨 150040

小黑杨 PsnHSFs 生物信息学 胁迫应答

转基因生物新品种培育重大专项

2018ZX08020002

2021

10.12171/j.1000-1522.20200159

北京林业大学学报
北京林业大学

北京林业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.237
ISSN：1000-1522
年,卷(期)：2021.43(2)
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