北京林业大学学报2021,Vol.43Issue(7) :12-21.DOI:10.12171/j.1000-1522.20210037

镉胁迫下美洲黑杨无性系'中菏1号'转录组分析

Transcriptome analysis of clone Populus deltoides 'Zhonghe 1' under cadmium stress

宋润先 李翔 毛秀红 王丽 陈香丽 姚俊修 赵曦阳 李善文
北京林业大学学报2021,Vol.43Issue(7) :12-21.DOI:10.12171/j.1000-1522.20210037

镉胁迫下美洲黑杨无性系'中菏1号'转录组分析

Transcriptome analysis of clone Populus deltoides 'Zhonghe 1' under cadmium stress

宋润先 1李翔 1毛秀红 2王丽 3陈香丽 4姚俊修 2赵曦阳 1李善文2
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作者信息

  • 1. 东北林业大学林学院,林木遗传育种国家重点实验室,黑龙江 哈尔滨 150040
  • 2. 山东省林业科学研究院,山东省林木遗传育种改良重点实验室,山东 济南 250014
  • 3. 山东省林业监测规划院,山东 济南 250014
  • 4. 单县国有故道林场,山东 单县 274300
  • 折叠

摘要

[目的]通过转录组测序和分析,发掘美洲黑杨无性系'中菏1号'耐镉关键功能基因,揭示美洲黑杨在镉胁迫下的响应机制.[方法]以'中菏1号'为试验材料,通过沙培试验法对处在不同质量浓度(0 mg/L(ZH1C0),10 mg/L(ZH1C1),20 mg/L(ZH1C2))Cd2+环境下的无性系进行胁迫处理,而后采集叶片,提取RNA,并使用Illumina HiSeqTM2500系统对转录组进行高通量测序.[结果]主成分分析确定PC1作为区分不同Cd2+浓度样本的标准;经过差异表达分析,在ZH1C0和ZH1C2之间共检测到4109条差异基因,其中2741条基因显著上调表达,1368条基因显著下调表达;在ZH1C1和ZH1C2之间检测到3710条差异基因,其中1969条基因显著上调表达,1741条基因显著下调表达;不同数据库之间的注释表明Cd2+不仅会影响叶绿体、线粒体等细胞器的微结构,而且会干扰光合作用和呼吸作用中的电子传递.转录因子分析发现,WRKY、MYB、ZIP、ERF、bHLH在镉胁迫响应和耐受中具有重要作用.[结论]在'中菏1号'中,异戊二烯化植物蛋白在阻止Cd2+进入细胞内部发挥了重要作用;谷胱甘肽不仅可以促进细胞内Cd2+的螯合,还可以缓解细胞内的氧化胁迫;ABC家族蛋白和MATE家族蛋白是'中菏1号'体内转移Cd2+螯合蛋白的关键载体.

关键词

镉胁迫/美洲黑杨无性系'中菏1号'/转录组

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基金项目

出版年

2021
北京林业大学学报
北京林业大学

北京林业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.237
ISSN:1000-1522
参考文献量19
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