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油料树种千年桐的SSR标记开发、遗传多样性与群体结构分析

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[目的]千年桐是大戟科油桐属的一种重要的工业油料树种,较同属的油桐具有更强的抗枯萎病能力,近年来受到了广泛关注.然而,因千年桐栽培历史短及种质管理的不足,目前对其分子遗传方面的研究还非常有限.本研究旨在开发千年桐的基因组SSR标记,进而开展其种质的鉴定、遗传多样性与群体结构分析.[方法]采用RAD测序技术获得千年桐简化基因组以开发SSR标记,基于SSR标记利用分子变异分析(AMOVA)、非加权组平均法(UPGMA)聚类、主坐标(PCoA)与群体结构分析等方法对来自3个不同地理分布的共105份千年桐种质资源进行研究.[结果]17个多态性的三核苷酸基因组SSR标记被开发,并能够很好地鉴别所有收集的105份千年桐种质.在其中62份种质中检测到85个私有等位基因,涉及15个SSR位点.AMOVA分析发现,千年桐群体间呈现出中等程度的遗传分化,但群体内的遗传变异远高于群体间的遗传变异.群体结构分析显示,3个来自不同地理分布的千年桐群体中存在4个不同的基因库,群体间既有进化独立性,又有较高程度的遗传混合,这一结果与UPGMA和PCoA分析的结果基本一致.[结论]新开发的17个SSR标记有效鉴定了105份千年桐种质,揭示了其遗传多样性和群体遗传结构,对千年桐种质保存和育种计划具有非常重要的参考价值.
SSR marker development, genetic diversity and population structure analysis in oil tree species Vernicia montana

赵盼、栗丹阳、马锦林、梁文汇、庞晓明、龙萃、马婧怡、郭惠红

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林木育种国家工程实验室,北京林业大学生物科学与技术学院,北京 100083

广西壮族自治区林业科学研究院,广西 南宁 530002

千年桐 SSR标记 种质鉴定 遗传多样性 群体结构

中央高校基本科研业务费专项国家自然科学基金

2017ZY2431870650

2021

10.12171/j.1000-1522.20210054

北京林业大学学报
北京林业大学

北京林业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.237
ISSN：1000-1522
年,卷(期)：2021.43(11)
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