北京农学院学报2020，Vol.35Issue(3) ：64-68.

解淀粉芽胞杆菌BJ-6基因组测序与抗菌代谢产物合成基因分析

Whole genome sequences of Bacillus amyloliquefaciens BJ-6 and analysis of biosynthesis genes of antibiotic metabolite

贾慧慧 王超男 魏艳敏 赵晓燕 高坦坦 任争光
北京农学院学报2020，Vol.35Issue(3) ：64-68.
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解淀粉芽胞杆菌BJ-6基因组测序与抗菌代谢产物合成基因分析

Whole genome sequences of Bacillus amyloliquefaciens BJ-6 and analysis of biosynthesis genes of antibiotic metabolite

贾慧慧 1王超男 1魏艳敏 1赵晓燕 2高坦坦 2任争光2
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作者信息

  • 1. 北京农学院农业应用新技术北京市重点实验室/植物生产国家级实验教学示范中心,北京102206
  • 2. 北京农学院农业农村部华北都市农业重点实验室,北京102206
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摘要

[目的]解淀粉芽胞杆菌(Bacillus am yloliquefaciens)是目前植物病害生物防治研究的热点之一.为了探索解淀粉芽胞杆菌BJ-6的生防机制,对该菌株的全基因组进行测序分析.[方法]利用二代测序技术对解淀粉芽胞杆菌BJ-6进行全基因组测序,使用Prodigal等软件进行基因预测与功能注释,并搜寻主要的抗菌次级代谢产物合成基因簇,转录分析这些抗菌代谢产物合成基因的表达.[结果]解淀粉芽胞杆菌BJ-6基因组大小为4 175 709 bp,有4 261个基因,GC含量为46.12％,搜寻到7种抗菌次级代谢产物合成基因簇,其中表面活性素合成基因簇与模式菌株FZB42相比出现较大差异,这7种抗菌物质合成基因在12～60 h培养条件下均能正常表达.[结论]获得解淀粉芽胞杆菌BJ-6的全基因组序列信息,挖掘抗菌物质合成基因簇,为今后深入研究解淀粉芽胞杆菌BJ-6产生的抗菌物质及其抑菌机制提供保障.

关键词

解淀粉芽胞杆菌/基因组测序/抗菌代谢产物/转录表达

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基金项目

大北农青教基金(15ZK005)

北京市教委(科技创新)服务能力建设-科研计划(KM201710020007)

出版年

2020
北京农学院学报
北京农学院

北京农学院学报

影响因子：0.539
ISSN：1002-3186
被引量4
参考文献量6
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