北京农学院学报2021,Vol.36Issue(2) :36-41.DOI:10.13473/j.cnki.issn.1002-3186.2021.0208

叶用莴苣LsARF1的生物信息学分析及其表达

Bioinformatics analysis of leaf lettuce LsARF1 and expression analysis in high-temperature bolting

武扬 姜尚昆 韩春晖 王婷甄 范双喜 郝敬虹
北京农学院学报2021,Vol.36Issue(2) :36-41.DOI:10.13473/j.cnki.issn.1002-3186.2021.0208

叶用莴苣LsARF1的生物信息学分析及其表达

Bioinformatics analysis of leaf lettuce LsARF1 and expression analysis in high-temperature bolting

武扬 1姜尚昆 1韩春晖 1王婷甄 1范双喜 1郝敬虹1
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作者信息

  • 1. 农业应用新技术北京市重点实验室/北京农学院植物科学技术学院,北京102206
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摘要

[目的]为了探究LsARF1基因在叶用莴苣抽薹中的作用机制.[方法]采用ProtParam、SignalP4.0、SOPMA、NCBI CD-search、SWISS-MODEL、DNAMAN7.0、MEGA7等生物学软件对其进行生物信息学分析.实时荧光定量PCR分析该基因在不同温度下随时间变化的表达情况.[结果]序列分析表明,该基因的开放阅读框为1968bp,编码656个氨基酸,并保留了ARF结构域.实时荧光定量PCR分析表明,在高温处理下,该基因在易抽薹品种GB-30中表达下调.[结论]LsARF1基因可能在生菜抽薹过程中发挥重要作用.

关键词

叶用莴苣/LsARF1/生物信息学/表达/分析

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基金项目

国家自然科学基金面上项目(31972400)

2018年北京市自然科学基金-北京市教委联合重点项目(KZ201810020027)

现代农业产业技术体系北京市叶类蔬菜创新团队(BAIC07-2020)

北京农学院学位与研究生教育改革与发展项目(2019YJS028)

2019年度北京高等学校高水平人才交叉培养“实培计划”大学生科研训练计划深化项目()

高精尖学科建设项目()

出版年

2021
北京农学院学报
北京农学院

北京农学院学报

影响因子:0.539
ISSN:1002-3186
被引量1
参考文献量2
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