北京农学院学报2022,Vol.37Issue(2) :33-38.DOI:10.13473/j.cnki.issn.1002-3186.2022.0207

苹果属PP2C A亚家族基因的克隆及生信分析

Cloning and bioinformatics analysis of group A-PP2C genes in'Malus hupehensis Rehd.'

许璇 何钰贤 姚允聪 卢艳芬
北京农学院学报2022,Vol.37Issue(2) :33-38.DOI:10.13473/j.cnki.issn.1002-3186.2022.0207

苹果属PP2C A亚家族基因的克隆及生信分析

Cloning and bioinformatics analysis of group A-PP2C genes in'Malus hupehensis Rehd.'

许璇 1何钰贤 1姚允聪 1卢艳芬1
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作者信息

  • 1. 北京农学院植物科学技术学院/农业应用新技术北京重点实验室,北京102206
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摘要

[目的]为探明苹果属植物响应脱落酸信号的分子机制.[方法]根据拟南芥PP2CA亚家族基因编码区序列进行同源性分析,利用RT-PCR技术,从'平邑甜茶'cDNA中得到并克隆了 3种MhPP2C基因,随后利用生物信息学手段分析其序列特征.[结果]分离得到的3种PP2C A亚家族基因MhABI1、MhABI2和MhHAB分别编码552,552和544个氨基酸的亲水性蛋白,其预测表观相对分子量分别为59.38、59.44、58.26 kDa,理论等电点为4.52~5.03;其中1个稳定蛋白和2个不稳定蛋白.这3个蛋白均含有PP2C超家族保守功能结构域,无跨膜结构及信号肽序列,主要定位于细胞核.[结论]这3种苹果属PP2CA亚家族基因可能在苹果砧木'平邑甜茶'ABA信号网络中发挥重要作用.

关键词

蛋白磷酸酶/脱落酸/基因/克隆/生物信息学/苹果属

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基金项目

国家自然科学基金(31872081)

北京市农委2018年度新型生产经营主体科技能力提升项目(20180202)

出版年

2022
北京农学院学报
北京农学院

北京农学院学报

影响因子:0.539
ISSN:1002-3186
被引量1
参考文献量4
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