北京农学院学报2023,Vol.38Issue(3) :12-15.DOI:10.13473/j.cnki.issn.1002-3186.2023.0303

莱茵衣藻CrGPAT基因的克隆及分析

Molecular cloning and analysis of GPAT from Chlamydomonas reinhardtii

贺志敏 张峻鑫 于丽平 胡康 石睿 黄体冉 杨明峰
北京农学院学报2023,Vol.38Issue(3) :12-15.DOI:10.13473/j.cnki.issn.1002-3186.2023.0303

莱茵衣藻CrGPAT基因的克隆及分析

Molecular cloning and analysis of GPAT from Chlamydomonas reinhardtii

贺志敏 1张峻鑫 1于丽平 1胡康 1石睿 1黄体冉 1杨明峰1
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作者信息

  • 1. 北京农学院生物与资源环境学院,北京102206
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摘要

[目的]探究CrGPAT在莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)油脂合成中的作用.[方法]通过RT-PCR方法克隆了莱茵衣藻CrGPAT基因,对其理化性质、信号肽、蛋白结构域、高级结构进行分析,构建系统发育树.采用荧光定量PCR检测CrGPAT基因表达量.[结果]结果表明,CrGPAT基因编码区全长为1 233 bp,共编码410个氨基酸.GPAT相对分子质量为102 kDa,等电点为4.94,平均疏水性为0.805,脂肪系数为17.85,分子式为C3536H5841N1233O1442S415,不稳定指数为45.30,属于不稳定蛋白质,为非分泌蛋白且不具有信号肽和蛋白跨膜区.二级结构预测表明CrGPAT蛋白由4种结构组成,其中α螺旋占43.17%,是CrGPAT蛋白最主要的二级结构.同时,系统发育分析表明,CrGPAT与团藻(Volvox)亲缘关系最近.[结论]CrGPAT能够在衣藻体内正常表达且在缺氮条件下表达量会显著提高,为进一步提高莱茵衣藻体内油脂量提供理论依据.

关键词

莱茵衣藻/GPAT/基因克隆/生物信息学

Key words

Chlamydomonas reinhardtii/GPAT/gene cloning/bioinformatics

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基金项目

北京市市属高等学校高水平教学创新团队建设支持计划(BPHR20220211)

出版年

2023
北京农学院学报
北京农学院

北京农学院学报

影响因子:0.539
ISSN:1002-3186
参考文献量1
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