摘要
[目的]为了解析苹果矮化中间砧'SH6'叶绿体基因组特征及其进化关系.[方法]以苹果矮化中间砧'SH6'为试材,通过HIFI测序,利用Organelle_PBA软件进行叶绿体基因组从头组装,分析其叶绿体基因组特征.[结果]结果表明,'SH6'叶绿体基因组大小为160 069 bp,具有典型的四分结构,包括大单拷贝区域、小单拷贝区域和两个反向重复区域,长度分别为88 184 bp、19 181 bp、26 352 bp和26 352 bp.在'SH6'叶绿体基因组中,分别注释了蛋白质编码基因、tRNA和rRNA,其数量分别为86、36和8.此外,整合已发表的'国光'、河南海棠、2个野生苹果和桃(Prunus persica)的叶绿体基因组数据来构建系统发育树,发现苹果中间砧'SH6'与欧洲森林苹果聚在一枝上.[结论]推测苹果矮化中间砧品种'SH6'与欧洲森林苹果关系较为密切.
基金项目
北京市教委科研一般项目(KM202310020010)
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