蚕业科学2022,Vol.48Issue(6) :477-488.DOI:10.13441/j.cnki.cykx.2022.06.001

白桑bZIP基因家族的全基因组鉴定及表达谱分析

Genome-Wide Identification and Expression Profile of bZIP Gene Family in White Mulberry,Morus alba L.

邓璇 陈春兵 刘练练 邓静 李娟 查幸福
蚕业科学2022,Vol.48Issue(6) :477-488.DOI:10.13441/j.cnki.cykx.2022.06.001

白桑bZIP基因家族的全基因组鉴定及表达谱分析

Genome-Wide Identification and Expression Profile of bZIP Gene Family in White Mulberry,Morus alba L.

邓璇 1陈春兵 1刘练练 1邓静 1李娟 1查幸福1
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作者信息

  • 1. 西南大学,家蚕基因组生物学国家重点实验室,重庆 400715
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摘要

碱性亮氨酸拉链转录因子(bZIP)是真核生物中广泛存在的转录因子,对于植物生长发育的作用意义非凡.通过同源检索在白桑基因组中共鉴定得到50个MabZIP基因,其仅在桑树的12条染色体上分布,且分布不均匀.理化性质分析发现有27个bZIP的等电点小于7.0,表明桑树的bZIP家族成员超过一半为酸性蛋白,亚细胞定位预测50个bZIP蛋白皆位于细胞核.参照拟南芥bZIP分支情况可将桑树的bZIP分为12个亚族,其中A亚族蛋白数目最多.桑树bZIP家族的同一亚族具有相似的外显子数目,不同亚族外显子数目从1~18个不等.组织表达分析表明,桑树bZIP家族大部分基因在根、茎、叶和果实中均有表达,少数基因只在特定组织表达.研究结果为桑树bZIP的克隆及功能研究提供了理论支撑.

关键词

白桑/碱性亮氨酸拉链转录因子/全基因组鉴定/表达谱分析

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基金项目

出版年

2022
蚕业科学
中国蚕学会 中国农业科学院蚕业研究所

蚕业科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.58
ISSN:0257-4799
被引量1
参考文献量1
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