黑果枸杞GRF转录因子家族鉴定与生物信息学分析

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中文摘要：为探究黑果枸杞(Lycium ruthenicum)GRF基因家族成员在盐胁迫下的耐盐分子机制,采用生物信息学方法,对黑果枸杞转录组数据库进行分析,并对GRF家族成员的理化性质、保守结构域、进化树、基因家族表达谱进行分析.结果表明,通过转录组数据共筛选出14个GRF家族成员,这些蛋白编码氨基酸的个数为136～585 aa,等电点为5.58～9.33,分子量为14.56697～62.98665 kDa.保守基序表明,多数黑果枸杞GRF的N端具有QLQ和WRC保守结构域.系统进化分析发现,14个LrGRFs被分为7个亚族,位于同一亚族的GRF基序组成相似,部分黑果枸杞GRF与番茄GRF具有相对应的进化关系.表达谱表明,不同组织的LrGRFs在不同盐胁迫下均有响应,其中LrGRF6,LrGRF10和LrGRF12在根中高表达,而LrGRF2,LrGRF6和LrGRF10在叶中表现为高表达,这表明其可能在黑果枸杞中发挥着更加重要的调控作用.结果为进一步深入揭示LrGRFs在盐胁迫环境下的分子机制奠定了理论基础.

外文标题：Identification and Bioinformatic Analysis of GRF Transcription Factor Family in Lycium ruthenicum Murr.

作者：

杜雨、刘筠、胡晓桐、贾西贝、柳迪、马彦军

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作者单位：

甘肃农业大学林学院,甘肃兰州 730070

关键词：

黑果枸杞 NaCl胁迫 GRF基因家族生物信息学进化树表达谱分析

基金：

甘肃省自然科学基金国家自然科学基金国家自然科学基金

项目编号：

20JR10RA5303176024431560215

出版年：

2022

DOI：

10.11733/j.issn.1007-0435.2022.06.011

草地学报

中国草学会

草地学报

CSTPCDCSCD北大核心

影响因子：1.156

ISSN：1007-0435

年,卷(期)：2022.30(6)

被引量3
参考文献量11