首页|黑果枸杞XTH转录因子家族鉴定与生物信息学分析

黑果枸杞XTH转录因子家族鉴定与生物信息学分析

扫码查看
原文链接
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
为探究木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(Xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTHs)基因家族在黑果枸杞(Lycium ruthenicum)生长发育中的作用,以及对盐胁迫的响应,本文通过生物信息学方法对XTHs基因的理化性质、保守结构域、进化关系和表达模式进行分析.从黑果枸杞转录组数据中共筛选出19个LrXTHs成员,其编码氨基酸的数目为258～330 aa,分子量为29.77～37.98 kDa,等电点为4.98～8.92,基因长度为954～1814 bp.LrXTHs成员都含DE(I/L/F/V)D(F/I/M)EFLG保守结构域.系统发育树显示XTH基因家族可分为4个亚族.基因表达谱显示不同组织中的LrXTHs在盐胁迫下具有不同的表达趋势,LrXTH3,LrXTH18和LrXTH19在根部组织中高表达,LrXTH9在根部和叶部组织中高表达,表明LrXTHs可能在黑果枸杞的盐胁迫响应中发挥重要作用.该结果为黑果枸杞及XTH家族的进一步研究提供了参考.
Identification and Bioinformatics Analysis of XTH Transcription Factor Family in Lycium ruthenicum

Lycium ruthenicumNaCl stressXTH transcription factorBioinformaticsEvolutionary tree

贾西贝、李效雄、杜雨、胡晓桐、刘筠、马彦军

展开 >

甘肃农业大学林学院,甘肃 兰州 730070

兰州资源环境职业技术大学,甘肃 兰州 730030

黑果枸杞 NaCl胁迫 XTH转录因子 生物信息学 系统发育树

甘肃省高等学校产业支撑计划兰州资源环境职业技术大学重点研究项目兰州市科技计划

2023CYZC-46X2022ZD-052022-2-22

2023

10.11733/j.issn.1007-0435.2023.10.003

草地学报
中国草学会

草地学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.156
ISSN：1007-0435
年,卷(期)：2023.31(10)
  • 1
  • 9