摘要
利用与急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)具有高度同源性的人冠状病毒类木瓜蛋白酶(human coronavirus papain-like protease)晶体,对木瓜样蛋白酶(PLpro)进行同源模建,再通过该模建的蛋白对已上市或已进入临床试验的药物运用分子对接的方法进行虚拟筛选和动力学模拟研究,以找到对SARS-CoV-2引起的新冠肺炎疾病(COVID-19)可能具有治疗作用的药物.经过筛选,共确定了11种与SARS-CoV-2 PLpro结合较好的候选药物.分子动力学模拟和结合自由能分析结果表明:疏水性相互作用在候选药物与PLpro的结合过程中具有重要作用,并且发现替诺福韦艾拉酚胺(Tenofovir alafenamide)具有对COVID-19治疗的潜力.虚拟筛选是一种快速且经济的药物筛选的方法,用此方法筛选得到的替诺福韦艾拉酚胺可能可以作为候选药物对COVID-19进行治疗.
基金项目
重庆市科技局基础研究与前沿探索项目(cstc2018jcyjAX0683)
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