重庆理工大学学报2020，Vol.34Issue(11) ：215-223.DOI:10.3969/j.issn.1674-8425(z).2020.11.029

基于3D-QSAR和分子对接设计新型缺氧诱导因子脯氨酸羟化酶结构域蛋白1抑制剂

Design of Novel Hypoxia-Inducible Factor Proline Hydroxylase Domain Protein 1 Inhibitors Based on 3D-QSAR and Molecular Docking

储涵 何华玉 何清秀 王娟 林治华
重庆理工大学学报2020，Vol.34Issue(11) ：215-223.DOI:10.3969/j.issn.1674-8425(z).2020.11.029
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基于3D-QSAR和分子对接设计新型缺氧诱导因子脯氨酸羟化酶结构域蛋白1抑制剂

Design of Novel Hypoxia-Inducible Factor Proline Hydroxylase Domain Protein 1 Inhibitors Based on 3D-QSAR and Molecular Docking

储涵 1何华玉 2何清秀 1王娟 1林治华1
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作者信息

  • 1. 重庆理工大学 药学与生物工程学院,重庆 400054
  • 2. 重庆市九龙坡区妇幼保健院,重庆 400030
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摘要

选择了44个1,2,4-三唑-[1,5-a]吡啶类化合物,利用CoMFA和CoMSIA模型进行了3D-QSAR研究.结果表明:CoMFA(n=7;q2=0.712;r2=0.969)和CoMSIA(n=10;q2=0.754;r2=0.985)具有良好的稳定性和可预测性.随后,应用分子对接方法研究了活性位点的关键氨基酸和配体分子的对接模式.通过分析空间场、疏水场、静电场和氢键受体场的等势图以及对接模型,确定了该类化合物的改造和修饰区域,设计了8个新的1,2,4-三唑-[1,5-a]吡啶类化合物,并预测了它们的活性.结果表明:这些化合物具有良好的预测活性和对接得分,尤其是化合物21-g,可作为先导化合物进一步研究.研究结果为发现和设计新的PHD-1抑制剂提供了参考.

关键词

缺氧诱导因子脯氨酸羟化酶结构域蛋白/1,2,4-三唑-[1,5-a]吡啶类化合物/3D-QSAR/分子对接

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基金项目

重庆市自然科学基金重点项目(cstc2018jcyjAX0683)

重庆市自然科学基金重点项目(cstc2015jcyjBX0080)

出版年

2020
重庆理工大学学报
重庆理工大学

重庆理工大学学报

CSTPCD北大核心
影响因子：0.567
ISSN：1674-8425
参考文献量1
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