重庆理工大学学报2021，Vol.35Issue(3) ：242-251.DOI:10.3969/j.issn.1674-8425(z).2021.03.032

基于加权共表达网络预测结直肠癌的核心基因

Prediction of Colorectal Cancer Core Genes Based on Weighted Co-Expression Network

兰燕 张旭
重庆理工大学学报2021，Vol.35Issue(3) ：242-251.DOI:10.3969/j.issn.1674-8425(z).2021.03.032
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基于加权共表达网络预测结直肠癌的核心基因

Prediction of Colorectal Cancer Core Genes Based on Weighted Co-Expression Network

兰燕 1张旭1
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作者信息

  • 1. 西南大学 数学与统计学院,重庆 400715
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摘要

研究根据GE O数据库下载的包括17对结直肠癌组织和正常组织的基因芯片数据集GSE32323,对方差前25％的基因进行加权共表达网络分析得到10个模块,然后利用P<0.05选出与结直肠癌显著最相关的2个模块,用DAVID数据库对其进行GO和KEGG富集分析,表明这2个模块主要富集在细胞调控、细胞外泌体、代谢通路和细胞分裂、蛋白结合、细胞周期、P53信号通路等过程.再用Cytoscape对核心模块可视化,根据GEPIA数据库作生存分析,由P<0.05得到PPARG,ACO2,MYC,CCNB2和NUP37共5个核心基因作为结直肠癌可能的生物标志物,为结直肠癌治疗药物靶点的选取奠定了理论基础.

关键词

结直肠癌/核心基因/加权共表达网络/功能富集分析/生存分析

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基金项目

国家自然科学基金(11701471)

重庆市基础科学与前沿技术研究项目(cstc2017jcyjAX0476)

出版年

2021
重庆理工大学学报
重庆理工大学

重庆理工大学学报

CSTPCD北大核心
影响因子：0.567
ISSN：1674-8425
被引量2
参考文献量4
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