茶叶学报2023,Vol.64Issue(2) :29-36.DOI:10.20045/j.cnki.issn.2096-0220.2023.02.004

基于RNA-Seq分析茶树新品系'春绿'生物信息

RNA-Seq Analysis on A New Tea Strain, Chunlv

林郑和 孔祥瑞 陈常颂 李鑫磊 张亚真 游小妹 陈志辉 单睿阳 钟秋生
茶叶学报2023,Vol.64Issue(2) :29-36.DOI:10.20045/j.cnki.issn.2096-0220.2023.02.004

基于RNA-Seq分析茶树新品系'春绿'生物信息

RNA-Seq Analysis on A New Tea Strain, Chunlv

林郑和 1孔祥瑞 1陈常颂 2李鑫磊 1张亚真 1游小妹 1陈志辉 1单睿阳 1钟秋生1
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作者信息

  • 1. 福建省农业科学院茶叶研究所/国家茶树改良中心福建分中心,福建 福州 350013
  • 2. 福建省农业科学院茶叶研究所/国家茶树改良中心福建分中心,福建 福州 350013;国家土壤质量福安观测实验站,福建 福安 355015
  • 折叠

摘要

[目的]为加深对茶树新品系'春绿'分子机制及优异性状的遗传基础的了解.[方法]以茶树品种(系)'福云6号'和春绿叶片为材料,利用第二代测序技术,构建基因转录本.[结果]获得新品系春绿的Clean reads达到47.37 M,比对照福云6号少0.76 M;共拼装成41159条unigenes,其中31706条unigenes能被GO数据库成功注释,分别涉及到3651个GO组.差异显著基因有7042条,分别为23个生物学过程的GO组、20个细胞成分的GO组及21个基于分子功能的GO组.KEGG富集分析发现,有8657个基因注释到191个代谢通路中,这些基因中有1277个显著差异基因.66条DEGs参与苯丙素的生物合成(ko00940),3条DEGs参与谷胱甘肽代谢(ko00480),40条DEGs参与卵母细胞减数分裂(ko04114),45条DEGs参与RNA降解(ko03018),14条DEGs参与角质、亚伯碱和蜡的生物合成(ko00073).[结论]转录组测序分析结果阐明了春绿新品系生长发育的部分分子信息,对利用其进一步开展分子辅助育种等具有较为重要的意义.

关键词

茶树/新品系/转录组/生物信息学

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基金项目

福建省属公益类科研院所基本科研专项(2020R1029002)

福建省属公益类科研院所基本科研专项(2021R1029006)

福建省自然科学基金(2020J011365)

国家茶叶产业技术体系建设项目(CARS-19)

"5511"协同创新工程项目(XTCXGC2021004)

福建省引导性项目(2022N0055)

出版年

2023
茶叶学报
福建省农业科学院茶叶研究所

茶叶学报

影响因子:0.576
ISSN:2096-0220
参考文献量6
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