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基于线粒体COX1和ND1基因顺序的黄河上游大鼻吻遗传多样性分析

Genetic diversity analysis of Rhinogobio nasutus in the upper Yellow River based on mtDNA COX1 and ND1 gene sequences

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为探究黄河上游大鼻吻(Rhinogobio nasutus)群体遗传多样性和遗传分化现状,本研究以永宁、 平罗、 磴口3个不同地理群体145尾大鼻吻为研究对象,利用线粒体DNA COX1和ND1基因序列进行了遗传多样性分析.结果显示:COX1和ND1基因序列长度分别为1466 bp、975 bp,A+T含量(57.25％,56.81％)均高于G+C(42.75％,43.19％)含量,具有明显的碱基组成偏向性;3个群体145尾样本中分别界定了11个和9个单倍型,均存在共享单倍型现象.在COX1和ND1基因序列中3个群体的平均单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(π)及平均核苷酸差异(K)分别为0.7453、0.0013、1.841和0.364、0.00048、0.472,3个群体遗传多样性呈现出磴口群体最高、平罗群体次之、永宁群体最小的特征.基于COX1和ND1的遗传变异分析(AMOVA),表明3个群体中遗传变异均主要来自群体内,且COX1基因序列中磴口群体与永宁群体之间存在显著性明显的遗传分化.基于线粒体COX1和ND1基因单倍型序列,采用邻近法(Neighbor Joining,NJ)构建系统进化树与单倍型网络结过具有一致性,表明3个群体之间无明显的谱系分化,结构比较单一,未发现形成单独分支的群体.中性检验结果显示,大鼻吻进化历程符合中性进化假设,且可能存在群体扩张.因此,为了有效地保护大鼻吻野生资源,建议将大鼻吻从整体上进行就地保护.

Rhinogobio nasutusYellow RiverCOX1ND1genetic diversity

杨立强、刘彦斌、苟金明、王吉祥、刘凯、肖伟、王永杰、杨瑞兰、柳婷、刘哲、连总强

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甘肃农业大学动物科学技术学院,兰州 730070

宁夏回族自治区水产研究所,银川 750001

宁夏渔业工程技术研究中心,银川 750001

宁夏回族自治区水产技术推广站,银川 750001

喀什大学生命与地理科学学院,新疆喀什 844000

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大鼻吻 (Rhinogobio nasutus) 黄河 COX1 ND1 遗传多样性

&&农业部财政专项

2023BCF01013HHDC-2022-02

2024

淡水渔业
中国水产学会 中国水产科学研究院长江水产研究所 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

淡水渔业

CSTPCD北大核心
影响因子：0.776
ISSN：1000-6907
年,卷(期)：2024.54(2)
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