淡水渔业2024,Vol.54Issue(2) :58-66.

基于线粒体COX1和ND1基因顺序的黄河上游大鼻吻遗传多样性分析

Genetic diversity analysis of Rhinogobio nasutus in the upper Yellow River based on mtDNA COX1 and ND1 gene sequences

杨立强 刘彦斌 苟金明 王吉祥 刘凯 肖伟 王永杰 杨瑞兰 柳婷 刘哲 连总强
淡水渔业2024,Vol.54Issue(2) :58-66.

基于线粒体COX1和ND1基因顺序的黄河上游大鼻吻遗传多样性分析

Genetic diversity analysis of Rhinogobio nasutus in the upper Yellow River based on mtDNA COX1 and ND1 gene sequences

杨立强 1刘彦斌 2苟金明 3王吉祥 4刘凯 2肖伟 2王永杰 2杨瑞兰 1柳婷 1刘哲 5连总强2
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作者信息

  • 1. 甘肃农业大学动物科学技术学院,兰州 730070;宁夏回族自治区水产研究所,银川 750001
  • 2. 宁夏回族自治区水产研究所,银川 750001;宁夏渔业工程技术研究中心,银川 750001
  • 3. 宁夏回族自治区水产技术推广站,银川 750001
  • 4. 宁夏回族自治区水产研究所,银川 750001;喀什大学生命与地理科学学院,新疆喀什 844000
  • 5. 甘肃农业大学动物科学技术学院,兰州 730070
  • 折叠

摘要

为探究黄河上游大鼻吻(Rhinogobio nasutus)群体遗传多样性和遗传分化现状,本研究以永宁、 平罗、 磴口3个不同地理群体145尾大鼻吻为研究对象,利用线粒体DNA COX1和ND1基因序列进行了遗传多样性分析.结果显示:COX1和ND1基因序列长度分别为1466 bp、975 bp,A+T含量(57.25%,56.81%)均高于G+C(42.75%,43.19%)含量,具有明显的碱基组成偏向性;3个群体145尾样本中分别界定了11个和9个单倍型,均存在共享单倍型现象.在COX1和ND1基因序列中3个群体的平均单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(π)及平均核苷酸差异(K)分别为0.7453、0.0013、1.841和0.364、0.00048、0.472,3个群体遗传多样性呈现出磴口群体最高、平罗群体次之、永宁群体最小的特征.基于COX1和ND1的遗传变异分析(AMOVA),表明3个群体中遗传变异均主要来自群体内,且COX1基因序列中磴口群体与永宁群体之间存在显著性明显的遗传分化.基于线粒体COX1和ND1基因单倍型序列,采用邻近法(Neighbor Joining,NJ)构建系统进化树与单倍型网络结过具有一致性,表明3个群体之间无明显的谱系分化,结构比较单一,未发现形成单独分支的群体.中性检验结果显示,大鼻吻进化历程符合中性进化假设,且可能存在群体扩张.因此,为了有效地保护大鼻吻野生资源,建议将大鼻吻从整体上进行就地保护.

关键词

大鼻吻/(Rhinogobio/nasutus)/黄河/COX1/ND1/遗传多样性

Key words

Rhinogobio nasutus/Yellow River/COX1/ND1/genetic diversity

引用本文复制引用

基金项目

&&(2023BCF01013)

农业部财政专项(HHDC-2022-02)

出版年

2024
淡水渔业
中国水产学会 中国水产科学研究院长江水产研究所 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

淡水渔业

CSTPCD北大核心
影响因子:0.776
ISSN:1000-6907
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参考文献量35
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