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环湖牦牛瘤胃微生物区系特征及性别之间的差异

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本试验旨在研究环湖牦牛瘤胃微生物区系特征及性别之间的差异.随机挑选4~5岁环湖牦牛健康公牛5头[平均体重为(228.0±19.4)kg]和母牛5头[平均体重为(198.0±8.4)kg],采用16S rDNA扩增子高通量测序的方法研究公、母牦牛瘤胃微生物区系特征和性别之间的差异.结果表明:2个性别间瘤胃微生物在门水平上组成相似,其中拟杆菌门(Bacte-roidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)和厚壁菌门(Firmicutes)是优势菌门,样品中平均相对丰度分别为51.74%、15.00%和14.34%.在属水平上,普氏菌属_1(Prevotella_1)、理研菌科RC9肠道群(Rikenellaceae_RC9_gut_group)和普雷沃氏菌科_UCG-001(Prevotellaceae_UCG-001)是优势菌属,平均相对丰度分别为16.11%、7.74%和3.43%.Alpha多样性指数中,公牛的Sobs指数为2689,极显著高于母牛(P<0.01),其余指数无显著性别差异(P>0.05).主坐标分析(PCoA)和相似性分析(Anosim)结果说明2个性别之间瘤胃微生物区系存在明显差异.在属水平上,公牦牛Rikenellaceae_RC9_gut_group的相对丰度显著高于母牦牛(P<0.05),母牦牛Pre-votella_1、毛螺菌科AC2044群(Lachnospiraceae_AC2044_group)、Saccharofermentans、Anaero-vorax和Elusimicrobium的相对丰度显著高于公牦牛(P<0.05).瘤胃微生物TAX4FUN预测功能比较发现,公、母牦牛瘤胃微生物功能在糖类代谢、氨基酸代谢、脂肪代谢及疾病相关等功能存在差异.从上述分析来看,性别对牦牛瘤胃微生物区系的组成有显著影响,尤其是在属水平上差异较大.
Rumen Microbiota Characteristics and Its Difference between Sex of Huanhu Yaks

韩学平、刘宏金、胡林勇、徐世晓、艾德强、付弘贇、陈永伟、赵建忠

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中国科学院西北高原生物研究所,西宁 810008

中国科学院高原生物适应和进化重点实验室,西宁 810008

中国科学院大学,北京 100049

青海省畜牧总站,西宁 810001

青海省农牧业工程项目咨询中心,西宁 810001

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牦牛 16SrDNA 瘤胃 微生物区系 性别 TAX4FUN

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2016YFC05019052016YFC0501805XDA200501042019-SF-1492019-SF-1532017-SF-A62017-NK-1532017-ZJ-Y20

2020

动物营养学报
中国畜牧兽医学会

动物营养学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.297
ISSN:1006-267X
年,卷(期):2020.32(1)
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